49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1882 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1882  cyclase family protein  100 
 
 		 223 aa  467  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1598  putative cyclase  40.97 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0561812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0937  cyclase family protein  26.99 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0915  cyclase family protein  26.99 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  27.91 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  27.44 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1590  cyclase family protein  28.12 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  30.61 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  27.83 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  26.84 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  25.71 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  24.77 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  30.69 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  29.94 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  22.89 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  29.19 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  26.77 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  27.17 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  28.04 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  29.21 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  26.79 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  26.79 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  27.38 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  25.79 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.21 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  26.79 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  26.98 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  26.79 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  27.75 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  26.79 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  26.79 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  26.19 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  29.89 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  26.19 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  29.41 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  25.11 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  24.65 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  26.51 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27.71 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  27.01 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  27.14 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  26.71 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  23.4 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  20.36 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  26.32 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  31.58 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  23.74 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  26.35 
 
 		 216 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  23.85 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>