130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4195 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  100 
 
 
121 aa  245  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  65.05 
 
 
125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  55 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  46.23 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  48.98 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  47.83 
 
 
107 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  48.98 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  42.22 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  48.98 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  34.95 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  39.77 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  38.2 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  37.76 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2800  hypothetical protein  45.9 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176742  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  46.05 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  37.14 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  39.33 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  44.3 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6815  protein of unknown function DUF971  38.3 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  38.37 
 
 
99 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  42.22 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  38.3 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  35.42 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  38.83 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  38.83 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  34.69 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  39.18 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  37.89 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  38 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  35.48 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  37.65 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0959  hypothetical protein  34.31 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145353  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  33.04 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0949  hypothetical protein  34.31 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  39.18 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  34.41 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  34.41 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  30.43 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  30.43 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  32.35 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  33.67 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  34.38 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  38.14 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  36.47 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  44.23 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  33.7 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  30.43 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  33 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  32.32 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  31.82 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  33 
 
 
123 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  32.99 
 
 
140 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  31.58 
 
 
139 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  30.16 
 
 
144 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3899  hypothetical protein  34.69 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.491521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  31.82 
 
 
138 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  33.04 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  32.35 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  29.59 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  35.42 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  33 
 
 
128 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  28.12 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1603  protein of unknown function DUF971  32.29 
 
 
132 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2386  protein of unknown function DUF971  32.65 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.44562  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  34.65 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  33.67 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  32.98 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  29.35 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  32.98 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  33.68 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  32.98 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  34.74 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  34.74 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  34.74 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  34.74 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  34.74 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  32.94 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2773  protein of unknown function DUF971  34.65 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174226  normal  0.0905596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  32.67 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  33.66 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  32 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  35.79 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  32 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  32 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  33.66 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  32 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  33.66 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  33.66 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  29.7 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2580  hypothetical protein  30.68 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  34 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1898  hypothetical protein  31.18 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.32912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>