129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0679 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  201  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  59.79 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  45.16 
 
 		 107 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  45.56 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  44.94 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  43.01 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  42.22 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  38.71 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  47.83 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  39.58 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  40.43 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  38.54 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  39.13 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  36.46 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  35.87 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  37.23 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  37.23 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  36.56 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  34.38 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1898  hypothetical protein  36.67 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.32912  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2580  hypothetical protein  38.78 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  36.84 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  34.83 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  34.83 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  34.83 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0462  hypothetical protein  34.83 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  38.04 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  36.96 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  35.48 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  37.89 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  36.56 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  35.87 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  38.04 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  38.04 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  38.04 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  35.87 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  38.04 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  45.45 
 
 		 97 aa  57  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  45.45 
 
 		 97 aa  57  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  39.78 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  35.87 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1603  protein of unknown function DUF971  36.67 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  33.7 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  36.96 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  39.08 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3766  hypothetical protein  28.89 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000239528  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3363  hypothetical protein  35.8 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  31.46 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66800  hypothetical protein  36.67 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  31.46 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  32.05 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  35.48 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  36.84 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4431  hypothetical protein  29.21 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.690938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  36.46 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  36.46 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  33.7 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5792  hypothetical protein  36.67 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  35.48 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  34.78 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  36.96 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  33.7 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  36.67 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  30.68 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  34.41 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  34.04 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  36.96 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  30.34 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  34.04 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  38.04 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  31.87 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  31.46 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  38.04 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  36.96 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  32.98 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  36.96 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  36.96 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  36.96 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  36.96 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  32.61 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  34.74 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  29.21 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  37.36 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  29.21 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  29.21 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  29.21 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  36.67 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  34.78 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2773  protein of unknown function DUF971  34.38 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174226  normal  0.0905596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>