129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3352 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  213  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  96.26 
 
 		 107 aa  205  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  94.74 
 
 		 99 aa  177  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  51.58 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  50.54 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  46.23 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  42.55 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  46.15 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  44 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  42.39 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  41.94 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  41.49 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  43.01 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  40.86 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  44.79 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  39.6 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  39.6 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  37.76 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  40.22 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  40.86 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  39.58 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  40 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  41.67 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3899  hypothetical protein  44.79 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.491521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  36.84 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  37.74 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2773  protein of unknown function DUF971  44.79 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174226  normal  0.0905596 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  39.13 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  35.42 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0220  protein of unknown function DUF971  41.49 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.635086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  38.14 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4130  protein of unknown function DUF971  38.38 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  37.62 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  38.37 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  37.63 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  34.38 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  36.56 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  36.56 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  42.71 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  42.71 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  43.01 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  38.71 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  36.78 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  36.46 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  37.63 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  37.63 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  37.63 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0959  hypothetical protein  35.42 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  35.64 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  36.08 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0949  hypothetical protein  35.42 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  34.78 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  36.08 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  35.96 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  38.38 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0528  hypothetical protein  32.61 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  36.78 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  36.56 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3363  hypothetical protein  35.11 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  40.45 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  40.45 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  38.04 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  36.56 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  40.45 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  37.11 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  37.93 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  34.41 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  34.95 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  36.46 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0780  hypothetical protein  31.68 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  36.56 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  35.05 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  36.73 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3766  hypothetical protein  32.97 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000239528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  42.25 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  35.96 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  57  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.690938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  38.2 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0462  hypothetical protein  35.48 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1054  protein of unknown function DUF971  40.66 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109891 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  39.53 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  39.53 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  39.58 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0370  hypothetical protein  35.05 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.040295  normal  0.643412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  37.5 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  35.87 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  36.46 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  37.21 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  36.17 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  38.55 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1603  protein of unknown function DUF971  30.19 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  44.44 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  44.44 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  31.91 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  31.91 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>