129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2074 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  64.71 
 
 		 125 aa  173  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  67.23 
 
 		 124 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  64.41 
 
 		 124 aa  170  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  60.5 
 
 		 119 aa  156  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0959  hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145353  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0949  hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  53.51 
 
 		 117 aa  140  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  54.31 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2773  protein of unknown function DUF971  55.46 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174226  normal  0.0905596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  52.94 
 
 		 124 aa  137  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  52.5 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  52.5 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  57.02 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3899  hypothetical protein  50.42 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.491521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  57.27 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  48.7 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  52.21 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  53.1 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1054  protein of unknown function DUF971  48.74 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  48.67 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0370  hypothetical protein  51.33 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.040295  normal  0.643412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  47.79 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  47.79 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  46.9 
 
 		 138 aa  116  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  47.79 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  51.33 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  46.61 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1603  protein of unknown function DUF971  46.9 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  45.61 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  50.44 
 
 		 138 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0220  protein of unknown function DUF971  47.79 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.635086  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4130  protein of unknown function DUF971  48.67 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  51.33 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  44.35 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  47.79 
 
 		 138 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  43.86 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0780  hypothetical protein  44.25 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  44.25 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  45.13 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  45.13 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  44.07 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  44.92 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  46.02 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  52.63 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  46.02 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  46.9 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  48.67 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  46.49 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  46.02 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  46.02 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  46.02 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  46.02 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  46.02 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  46.02 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  46.02 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  46.02 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  46.02 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  46.02 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1898  hypothetical protein  45.13 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.32912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  46.02 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  46.02 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  46.02 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  46.43 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  44.14 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  44.92 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  44.25 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0528  hypothetical protein  45.54 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4431  hypothetical protein  44.25 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.690938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  46.9 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  46.9 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  45.13 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  45.13 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  45.13 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  45.13 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  46.9 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  45.54 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  44.25 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  46.9 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  45.13 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  45.13 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  44.25 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  44.25 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  46.02 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  44.25 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0462  hypothetical protein  46.02 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  40.71 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3766  hypothetical protein  43.75 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000239528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  44.25 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5792  hypothetical protein  46.02 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3363  hypothetical protein  45.71 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66800  hypothetical protein  44.25 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  41.07 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  39.29 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1325  protein of unknown function DUF971  42.72 
 
 		 140 aa  90.1  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  40.71 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  45.56 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  45.56 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  41.94 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>