111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1978 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  88.04 
 
 		 92 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  78.26 
 
 		 95 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  79.12 
 
 		 106 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  78.65 
 
 		 106 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  65.93 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  58.11 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  46.59 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  43.18 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  43.96 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  43.96 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  41.38 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  41.11 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  40 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  38.89 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  42.05 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  42.39 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  37.93 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  37.93 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  39.53 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  39.53 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  34.78 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  38.04 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  31.18 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  30.85 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  34.04 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  34.48 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  30.53 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  32.97 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  30.43 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  31.18 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  31.18 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  31.18 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  31.18 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  33.68 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  30.85 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  31.18 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  31.18 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  31.18 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  32.61 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  31.46 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  34.07 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  32.18 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  32.18 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  30.85 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  35.23 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  32.97 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  32.94 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  31.58 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  32.97 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  31.18 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  32.97 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  29.47 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  29.47 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  29.47 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  29.47 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  29.47 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  30.43 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2386  protein of unknown function DUF971  31.18 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.44562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  32.18 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  32.58 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  29.9 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  31.52 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  34.78 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  28.74 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3766  hypothetical protein  28.41 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000239528  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  32.22 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  29.21 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3899  hypothetical protein  35.63 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.491521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  30.43 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  30.11 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3363  hypothetical protein  31.17 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  34.07 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2580  hypothetical protein  32.32 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  30.11 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  29.67 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  29.67 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  24.72 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  24.72 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  30.68 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  24.72 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  24.72 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2800  hypothetical protein  44.44 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176742  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  24.72 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  35.16 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  30.43 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  33.7 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  24.72 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1054  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1898  hypothetical protein  26.88 
 
 		 128 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.32912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3805  hypothetical protein  32.61 
 
 		 109 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0638296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  35.16 
 
 		 142 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  29.79 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>