125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2580 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2580  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  204  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  41 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  40.4 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  45.24 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  42.11 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0780  hypothetical protein  41.67 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  39.6 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5792  hypothetical protein  40.78 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  38.61 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  39 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  38.61 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  40.2 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  41.67 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  39.58 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  38.55 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  41.11 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  38.04 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0220  protein of unknown function DUF971  40.62 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.635086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66800  hypothetical protein  39.81 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  45.68 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  40.96 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2773  protein of unknown function DUF971  36.63 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174226  normal  0.0905596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  38.82 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  44.44 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  36 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3899  hypothetical protein  35.64 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.491521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  35.71 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  40.96 
 
 		 138 aa  57  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4130  protein of unknown function DUF971  37.5 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  41.03 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  38.38 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  32 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  40.96 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1898  hypothetical protein  39.13 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.32912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  36.78 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  39.39 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  34.41 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0959  hypothetical protein  37.35 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145353  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0949  hypothetical protein  37.35 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  37.37 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  36.73 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  36.05 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  32.94 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  39.76 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  36.36 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  37.21 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  35.29 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  38.78 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  34.52 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  37.89 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  36.78 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  34.52 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  34.52 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  38.75 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  34.52 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  31.31 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1054  protein of unknown function DUF971  34.02 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  43.06 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  30.3 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  35.64 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1603  protein of unknown function DUF971  33.67 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  30.3 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0370  hypothetical protein  39.76 
 
 		 138 aa  50.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.040295  normal  0.643412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0462  hypothetical protein  33.67 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  31.18 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  31.18 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  37.08 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  35.64 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6815  protein of unknown function DUF971  32.29 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  31.25 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0528  hypothetical protein  31.96 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4431  hypothetical protein  33.68 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.690938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  35.35 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  31.13 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>