72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6815 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6815  protein of unknown function DUF971  100 
 
 
101 aa  211  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3805  hypothetical protein  43.82 
 
 
109 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0638296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  41.77 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  41.03 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  41.03 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2433  protein of unknown function DUF971  44.26 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0839249  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  38.3 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2386  protein of unknown function DUF971  34.62 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.44562  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  39.02 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  36.84 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  38.27 
 
 
121 aa  50.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  36.99 
 
 
438 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  36.17 
 
 
93 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2580  hypothetical protein  32.29 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  38.89 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  37.5 
 
 
122 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  32.56 
 
 
144 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  35.44 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  34.41 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0370  hypothetical protein  37.33 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.040295  normal  0.643412 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  36.25 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  36.25 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  30.68 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  31.65 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  29.79 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  30.43 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  43.55 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  43.55 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  32.95 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  38.1 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  32.56 
 
 
140 aa  43.5  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  34.85 
 
 
140 aa  43.9  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  31.63 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  47.37 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  37.33 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  47.37 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  35.16 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  35.16 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  31.18 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  34.94 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  32.93 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  31.65 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  34.29 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  34.92 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  34.25 
 
 
123 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  30.56 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  32.86 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  36.07 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  32.86 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  32.86 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  31.17 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  32.86 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  36.07 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  30.68 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1325  protein of unknown function DUF971  29.11 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4130  protein of unknown function DUF971  31.82 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  34.38 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  27.27 
 
 
130 aa  40.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  29.73 
 
 
134 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  32.05 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2800  hypothetical protein  35 
 
 
132 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176742  normal  0.880482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>