131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6148 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  253  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  65.05 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  55.56 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  46.15 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  46.15 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  45.65 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  44 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  38 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2800  hypothetical protein  34.55 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176742  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  44.16 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  44.16 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  38.89 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  38.89 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  35.87 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  37.78 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  35.29 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  35.48 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  34.88 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  42.86 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  42.25 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  31 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  34.65 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  35.16 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  35.92 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  39.51 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  39.51 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  35.16 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  34.41 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  35.37 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6815  protein of unknown function DUF971  39.02 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  32.67 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  29.35 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  30.56 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  35.56 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3899  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.491521 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  32.26 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  31.37 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  30.11 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_004310  BR0959  hypothetical protein  31 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145353  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0949  hypothetical protein  31 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  29.63 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  47.22 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  32.38 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  32.98 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2386  protein of unknown function DUF971  35.24 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.44562  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  29.9 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  30.85 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  32.26 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  31.87 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  31.11 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5792  hypothetical protein  34.07 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  28.71 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  31.11 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  32.97 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  30.11 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  31.18 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  31.65 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66800  hypothetical protein  32.97 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  31.65 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  40 
 
 		 438 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0638296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  31.11 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  30.38 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  31.76 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  31.76 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  31.76 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0780  hypothetical protein  28.33 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  31.76 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  31.25 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  33.71 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  31.87 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  26.45 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  44.74 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  31.91 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  31.76 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  31.18 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  42.5 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  31.87 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2773  protein of unknown function DUF971  39.13 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174226  normal  0.0905596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  44.74 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0462  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2580  hypothetical protein  32.18 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  29.03 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  29 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  26.73 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  30.59 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1325  protein of unknown function DUF971  29.17 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  26.73 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  30.59 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  28 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  30.59 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  26.73 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  26.73 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>