132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1476 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  55 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  55.56 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  51.09 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  50.54 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  50.55 
 
 		 99 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  56.72 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2800  hypothetical protein  55.93 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176742  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  42.05 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  42.05 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  40.91 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  46.67 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  46.67 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  37.23 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  38.3 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  41.11 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  35 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  38.04 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  40.23 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  32.65 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  36 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  34.41 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0370  hypothetical protein  33.67 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.040295  normal  0.643412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  35.48 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  35.48 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3899  hypothetical protein  37.62 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.491521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  34 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  39.36 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  36.73 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  46.55 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  32.99 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  31.68 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_004310  BR0959  hypothetical protein  30.69 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  36.17 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  32.97 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0220  protein of unknown function DUF971  35.48 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.635086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0949  hypothetical protein  30.69 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  37.66 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  37.76 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  30.69 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  37.76 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  32.32 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  32.29 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  35.16 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  32.95 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  36.56 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  37.23 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  36.78 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  42.65 
 
 		 438 aa  50.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  31.31 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  32.05 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  37.63 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2773  protein of unknown function DUF971  35.71 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174226  normal  0.0905596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  32.05 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  32.99 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  32.05 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0528  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  32.05 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  29.29 
 
 		 137 aa  48.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  32.38 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  32.38 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  35.11 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  32.38 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  32.38 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  32.38 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  32.38 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  30.61 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  30.21 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  32.29 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  26.26 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  31.43 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  29.59 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2386  protein of unknown function DUF971  34.74 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.44562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  30.61 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  40.74 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  32.22 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  32.58 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4431  hypothetical protein  29.49 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.690938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1603  protein of unknown function DUF971  30.53 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  34.83 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>