83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5007 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  203  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  82.22 
 
 		 93 aa  157  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  58.43 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  56.04 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  46 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  46 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  51.11 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  51.11 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  47.25 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  48.35 
 
 		 92 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  45.05 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  46.59 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  46.59 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  38.37 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  37.78 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  37 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  38.55 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  39.08 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6815  protein of unknown function DUF971  36.84 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  38.75 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  41.77 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.485395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  35.48 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  32.29 
 
 		 144 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  32.63 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  37.63 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3805  hypothetical protein  36.99 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0638296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  39.44 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  33.73 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  55.26 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  44.12 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  31.91 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  55.26 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3363  hypothetical protein  36.9 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  52.5 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  57.89 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  38.81 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  31.52 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  52.5 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  31.31 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  33.73 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  31.52 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  33.73 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  33.73 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  33.73 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  33.73 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  32.53 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  35.16 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  33.73 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  33.73 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  32.95 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  47.62 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  32.65 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  35.06 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  35.14 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  35.06 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2800  hypothetical protein  38.33 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176742  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  45 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  34.85 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2773  protein of unknown function DUF971  37.68 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174226  normal  0.0905596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  54.05 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4431  hypothetical protein  30.95 
 
 		 131 aa  42  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.690938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0780  hypothetical protein  48.78 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  52.5 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  48.72 
 
 		 134 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  33 
 
 		 126 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  43.24 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1054  protein of unknown function DUF971  54.55 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  31.51 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  31.51 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  47.5 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  28.87 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5792  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  48.78 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1325  protein of unknown function DUF971  37.18 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  27.27 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  54.05 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4130  protein of unknown function DUF971  55.17 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  27.55 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>