125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1963 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  214  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  92.38 
 
 		 106 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  79.12 
 
 		 92 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  79.12 
 
 		 92 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  74.74 
 
 		 95 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  78.02 
 
 		 92 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  66.33 
 
 		 107 aa  123  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  46 
 
 		 99 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  44.44 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  50.56 
 
 		 93 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  43.96 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  43.96 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  34.95 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  38.14 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  35.87 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  34.95 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  37.23 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  36.46 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  30.19 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  36.67 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  36.08 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  36.84 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  35.11 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  35.11 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  34.78 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  30.69 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  31 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  39.58 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  32.99 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  34.83 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  34.04 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  33 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  34.74 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  33.7 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  32.63 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  37.89 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  34.41 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  34.74 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  33.7 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  34.74 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  29.59 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4051  hypothetical protein  32.61 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  33.7 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  35.11 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  36.84 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  35.14 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  33.7 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  31.25 
 
 		 122 aa  48.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  32.61 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0403  hypothetical protein  29.7 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.337193  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2386  protein of unknown function DUF971  29.7 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.44562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  29.25 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  33.7 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  33.7 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  33.7 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  34.69 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0648  protein of unknown function DUF971  31.52 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.887571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  32.29 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  32.98 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4431  hypothetical protein  26.8 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.690938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  31.52 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  30.39 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  32.65 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  30.93 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  28.71 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  36.56 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  35.19 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  30.21 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66800  hypothetical protein  35.79 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1054  protein of unknown function DUF971  28.44 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5792  hypothetical protein  34.38 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2580  hypothetical protein  32 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  27.78 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0462  hypothetical protein  32.61 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2876  protein of unknown function DUF971  35.35 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.040295  normal  0.643412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  30.53 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2649  hypothetical protein  35.35 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.265334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  31.31 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0638296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  31.91 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  23.71 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>