75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  187  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  58.62 
 
 
93 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  58.43 
 
 
99 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  51.76 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  53.26 
 
 
107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  50.56 
 
 
97 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  50.56 
 
 
97 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  50.56 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  56 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  50.56 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  58.11 
 
 
92 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  58.11 
 
 
92 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  49.33 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  44 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  46.05 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  37.5 
 
 
100 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  42.25 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  42.25 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  40.23 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  35.11 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  39.44 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2800  hypothetical protein  48.15 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176742  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2386  protein of unknown function DUF971  37.62 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.44562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  32.61 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0598  hypothetical protein  34.04 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302332  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2126  hypothetical protein  36.17 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  30.19 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  30.43 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  44.44 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3805  hypothetical protein  32.26 
 
 
109 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0638296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  31.82 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  29.35 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  31.25 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  30.43 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  28.26 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  30.68 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6815  protein of unknown function DUF971  38.1 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1325  protein of unknown function DUF971  32.47 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  29.21 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6196  hypothetical protein  31.46 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710102  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  29.55 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  29.55 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  26.09 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  29.21 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  27.17 
 
 
139 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  32 
 
 
124 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3899  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.491521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  28.74 
 
 
123 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4130  protein of unknown function DUF971  31.17 
 
 
137 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2580  hypothetical protein  29.27 
 
 
99 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  30.34 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  28.89 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  31.76 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  27.59 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  29.07 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  32.93 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  29.07 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3363  hypothetical protein  32.43 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  25 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1784  hypothetical protein  27.27 
 
 
126 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56936  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  25 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  30.67 
 
 
137 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  26.44 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  28.09 
 
 
125 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  29.07 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  26.44 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  26.44 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  29.87 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  26.44 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  32.93 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  28.09 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  29.21 
 
 
124 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2230  hypothetical protein  27.59 
 
 
119 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  57.69 
 
 
97 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>