61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4090 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  51.06 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  51.09 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  51.11 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  50.56 
 
 		 93 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  47.25 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  46.74 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  43.96 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  43.96 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  43.96 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  43.96 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  43.96 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  41.94 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  48.98 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  44.16 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  46.67 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  40.45 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  40.45 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  40.43 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2800  hypothetical protein  50.85 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176742  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  41.56 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  47.62 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  62.86 
 
 		 121 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45400  hypothetical protein  36.17 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40933  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2386  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.44562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3805  hypothetical protein  33.68 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0638296 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0531  hypothetical protein  35.56 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  54.29 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  34.88 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6815  protein of unknown function DUF971  43.55 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  30.3 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  46.81 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5792  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0648081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0393  hypothetical protein  35.23 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  32.61 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  32.61 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  42.55 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  48.57 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  42.55 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0462  hypothetical protein  35.16 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  42.55 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  42.55 
 
 		 128 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3363  hypothetical protein  41.94 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5142  hypothetical protein  34.09 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  47.83 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  35.16 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4876  hypothetical protein  35.16 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440599  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  40.43 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  51.43 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  36.25 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  36.25 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3766  hypothetical protein  39.06 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000239528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  35.16 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  36.84 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  51.43 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6713  protein of unknown function DUF971  51.43 
 
 		 124 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.919555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  40.43 
 
 		 128 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>