128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1042 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1042  Hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 263 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.81535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  76 
 
 		 419 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  74.29 
 
 		 419 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  66.11 
 
 		 432 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  67.46 
 
 		 429 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  68.64 
 
 		 446 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  72.78 
 
 		 428 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1132  hydroxypyruvate reductase  70.41 
 
 		 435 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  65.9 
 
 		 419 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  55.84 
 
 		 426 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  61.76 
 
 		 421 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  61.18 
 
 		 421 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  55.33 
 
 		 424 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  55.33 
 
 		 424 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  55.33 
 
 		 424 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  53.92 
 
 		 424 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  54.82 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  65.68 
 
 		 426 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  65.12 
 
 		 420 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  60.77 
 
 		 435 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  64.5 
 
 		 420 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  61.84 
 
 		 443 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  65.07 
 
 		 439 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  61.76 
 
 		 418 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  64.38 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  60.23 
 
 		 447 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  58.82 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  59.36 
 
 		 439 aa  178  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  55.68 
 
 		 448 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  64.8 
 
 		 424 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  53.48 
 
 		 438 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  60.36 
 
 		 421 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  54.01 
 
 		 446 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  54.01 
 
 		 440 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  55.61 
 
 		 440 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  56.15 
 
 		 440 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  56.61 
 
 		 421 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  51.15 
 
 		 432 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  59.48 
 
 		 440 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  58.86 
 
 		 444 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  57.22 
 
 		 448 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  50.28 
 
 		 424 aa  158  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  54.07 
 
 		 411 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  52.35 
 
 		 428 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  52.35 
 
 		 448 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  56.91 
 
 		 422 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0463  hydroxypyruvate reductase  47.43 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00870475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  54.3 
 
 		 422 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  48.55 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  51.53 
 
 		 422 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  47.93 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  47.15 
 
 		 404 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  54.55 
 
 		 460 aa  148  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  51.18 
 
 		 421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2230  hydroxypyruvate reductase  46.33 
 
 		 451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  52.63 
 
 		 423 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  50.31 
 
 		 422 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  50.87 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  56.67 
 
 		 427 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  51.46 
 
 		 424 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0433  hydroxypyruvate reductase  44.28 
 
 		 424 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0362  Hydroxypyruvate reductase  49.13 
 
 		 432 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2000  Hydroxypyruvate reductase  50.29 
 
 		 426 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0486  putative hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  49.13 
 
 		 432 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  50.32 
 
 		 421 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  48.7 
 
 		 452 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  52.38 
 
 		 407 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1897  hydroxypyruvate reductase  46.99 
 
 		 438 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.216641 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  51.7 
 
 		 413 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0477  hydroxypyruvate reductase  52.98 
 
 		 374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  45.16 
 
 		 450 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  54.12 
 
 		 415 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  47.95 
 
 		 453 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  40.22 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5205  hydroxypyruvate reductase  50.32 
 
 		 434 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.37508  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  56.67 
 
 		 423 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  44.71 
 
 		 443 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  56 
 
 		 423 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  49.03 
 
 		 434 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  46.36 
 
 		 445 aa  118  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  48.05 
 
 		 458 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  45.29 
 
 		 412 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  43.29 
 
 		 441 aa  116  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  43.93 
 
 		 409 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0659  hydroxypyruvate reductase  44.02 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  44.37 
 
 		 443 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  46.34 
 
 		 442 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  47.85 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  44.94 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  49.34 
 
 		 458 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  43.18 
 
 		 496 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2421  Hydroxypyruvate reductase  44.77 
 
 		 454 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  38.51 
 
 		 415 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5683  Hydroxypyruvate reductase  39.21 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3567  hydroxypyruvate reductase  43.53 
 
 		 426 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3413  Hydroxypyruvate reductase  35.71 
 
 		 443 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.691767  normal  0.696405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  43.14 
 
 		 486 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0380  MOFRL domain protein  42.86 
 
 		 504 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.328441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2747  hydroxypyruvate reductase  44.92 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  44.92 
 
 		 437 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>