68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0391 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  100 
 
 
644 aa  1306    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  53.47 
 
 
646 aa  729    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  34.21 
 
 
653 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  33.24 
 
 
655 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  33.05 
 
 
674 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  33.23 
 
 
674 aa  356  1e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  30.78 
 
 
658 aa  335  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  32.36 
 
 
661 aa  312  1e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.95 
 
 
726 aa  290  6e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.84 
 
 
749 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.25 
 
 
733 aa  282  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.638629 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1376  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.37 
 
 
757 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.23 
 
 
746 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  27.97 
 
 
637 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  27.74 
 
 
689 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  27.74 
 
 
686 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  27.6 
 
 
686 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  26.32 
 
 
689 aa  208  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  27.8 
 
 
680 aa  206  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  28.79 
 
 
659 aa  193  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.22 
 
 
676 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.97 
 
 
623 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  27.33 
 
 
651 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.31 
 
 
712 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  26.53 
 
 
648 aa  163  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  26.18 
 
 
649 aa  160  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.85 
 
 
643 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.63 
 
 
663 aa  151  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.37 
 
 
638 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  24.14 
 
 
646 aa  141  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.62 
 
 
615 aa  137  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.88 
 
 
615 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.15 
 
 
649 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.72 
 
 
657 aa  114  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.88 
 
 
632 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  22.9 
 
 
705 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.53 
 
 
625 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  28.07 
 
 
619 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.65 
 
 
643 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.97 
 
 
658 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.31 
 
 
458 aa  108  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0956  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.64 
 
 
668 aa  107  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2052  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.67 
 
 
689 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  24.13 
 
 
604 aa  97.4  7e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3224  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.46 
 
 
592 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.33 
 
 
695 aa  91.7  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  20.9 
 
 
628 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  19.52 
 
 
618 aa  87.4  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.76 
 
 
622 aa  87  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2896  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.33 
 
 
592 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0560963  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1693  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.48 
 
 
699 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.606133 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.28 
 
 
943 aa  73.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0743  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.92 
 
 
766 aa  70.5  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0579  V-type ATP synthase subunit I  21.88 
 
 
649 aa  69.7  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.91284  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  19.39 
 
 
842 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0549  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.02 
 
 
765 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52299  V0 domain of vacuolar H+ATPase  25 
 
 
791 aa  61.2  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.303606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1830  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.12 
 
 
590 aa  59.7  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0763  V-type ATPase, 116 kDa subunit  22.08 
 
 
765 aa  57.4  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.27354  normal  0.871767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3458  V-type ATPase 116 kDa subunit  34.38 
 
 
469 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
782 aa  54.3  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.75 
 
 
835 aa  52.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67737  vacuolar ATPase V0 domain subunit a  24.71 
 
 
947 aa  52.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.508189  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02320  vacuolar (H+)-ATPase subunit, putative  23.39 
 
 
849 aa  52  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1725  V-type ATPase, 116 kDa subunit  22.05 
 
 
767 aa  51.2  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  23.95 
 
 
2112 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.768634 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  18.26 
 
 
852 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  29.17 
 
 
818 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>