62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3348 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1376  V-type ATPase 116 kDa subunit  61.53 
 
 
757 aa  862    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  100 
 
 
749 aa  1502    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  48.88 
 
 
726 aa  680    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  49.15 
 
 
733 aa  659    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.638629 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  48.49 
 
 
746 aa  610  1e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  27.23 
 
 
646 aa  296  8e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  27.71 
 
 
644 aa  280  9e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  28.66 
 
 
674 aa  268  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  27.23 
 
 
655 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  25.96 
 
 
674 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  28.19 
 
 
658 aa  251  4e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  24.64 
 
 
653 aa  228  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  26.92 
 
 
661 aa  226  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  23.51 
 
 
689 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  23.51 
 
 
686 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  23.51 
 
 
686 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  23.34 
 
 
680 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  22.85 
 
 
689 aa  138  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.25 
 
 
649 aa  132  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  22.92 
 
 
659 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.48 
 
 
643 aa  111  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.37 
 
 
632 aa  108  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.95 
 
 
712 aa  103  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.84 
 
 
618 aa  99.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  21.52 
 
 
643 aa  96.3  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  21.15 
 
 
637 aa  96.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.57 
 
 
676 aa  90.5  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.24 
 
 
615 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  21.3 
 
 
628 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2052  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.26 
 
 
689 aa  83.2  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  22.52 
 
 
705 aa  82  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.53 
 
 
623 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.44 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.96 
 
 
638 aa  76.6  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.36 
 
 
695 aa  70.9  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  35.34 
 
 
615 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.94 
 
 
943 aa  68.9  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.46 
 
 
663 aa  68.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.58 
 
 
658 aa  68.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1693  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.49 
 
 
699 aa  67.8  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.606133 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67737  vacuolar ATPase V0 domain subunit a  21.4 
 
 
947 aa  65.1  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.508189  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0956  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.91 
 
 
668 aa  64.7  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  35.54 
 
 
619 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  19.92 
 
 
646 aa  60.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0579  V-type ATP synthase subunit I  21.08 
 
 
649 aa  59.7  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.91284  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.57 
 
 
835 aa  58.9  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
782 aa  58.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  22.45 
 
 
842 aa  57.8  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  25 
 
 
648 aa  57.4  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  22.34 
 
 
649 aa  57.4  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  28.11 
 
 
604 aa  57.4  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02320  vacuolar (H+)-ATPase subunit, putative  21.62 
 
 
849 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0753  H+-ATPase subunit I-like protein  32.37 
 
 
645 aa  55.8  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  31.65 
 
 
625 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  28.7 
 
 
818 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  21.32 
 
 
852 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.29 
 
 
651 aa  52.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.39 
 
 
622 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0549  V-type ATPase, 116 kDa subunit  29.52 
 
 
765 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  27.66 
 
 
657 aa  48.5  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0743  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.61 
 
 
766 aa  45.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52299  V0 domain of vacuolar H+ATPase  27.34 
 
 
791 aa  45.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.303606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>