66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2262 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  100 
 
 		 651 aa  1317    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.91 
 
 		 643 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.24 
 
 		 676 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  34.04 
 
 		 649 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  34.04 
 
 		 648 aa  355  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  32.02 
 
 		 638 aa  299  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  28.43 
 
 		 686 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  28.51 
 
 		 689 aa  265  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  32.04 
 
 		 663 aa  262  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  28.29 
 
 		 686 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  29.02 
 
 		 646 aa  254  3e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  27.22 
 
 		 689 aa  252  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  27.67 
 
 		 680 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  32.23 
 
 		 659 aa  206  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  27.45 
 
 		 657 aa  202  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  25.86 
 
 		 646 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  27.96 
 
 		 653 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  26.07 
 
 		 655 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.05 
 
 		 712 aa  171  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  26.81 
 
 		 644 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  23.97 
 
 		 658 aa  160  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  25.11 
 
 		 674 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  29.74 
 
 		 604 aa  155  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.16 
 
 		 618 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.41 
 
 		 674 aa  151  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.19 
 
 		 622 aa  146  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.07 
 
 		 637 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  25.74 
 
 		 661 aa  140  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.57 
 
 		 643 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.51 
 
 		 649 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3224  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.61 
 
 		 592 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.77 
 
 		 623 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2896  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.34 
 
 		 592 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0560963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.8 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.1 
 
 		 726 aa  108  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.14 
 
 		 632 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  25 
 
 		 615 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  22.9 
 
 		 943 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  22.94 
 
 		 705 aa  99  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.55 
 
 		 733 aa  97.4  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.638629 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.9 
 
 		 615 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  21.59 
 
 		 628 aa  92.4  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1830  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.63 
 
 		 590 aa  89.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.94 
 
 		 658 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2052  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.36 
 
 		 689 aa  84.7  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0956  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.86 
 
 		 668 aa  77.8  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3458  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.84 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.99 
 
 		 695 aa  74.7  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  19.62 
 
 		 749 aa  74.3  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0579  V-type ATP synthase subunit I  25.93 
 
 		 649 aa  73.6  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.91284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1376  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.52 
 
 		 757 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.86 
 
 		 835 aa  71.6  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  38 
 
 		 619 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.41 
 
 		 746 aa  55.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  31.37 
 
 		 842 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.51 
 
 		 625 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52299  V0 domain of vacuolar H+ATPase  29 
 
 		 791 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.303606 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0549  V-type ATPase, 116 kDa subunit  32.18 
 
 		 765 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67737  vacuolar ATPase V0 domain subunit a  31.68 
 
 		 947 aa  48.5  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.508189  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  24.34 
 
 		 782 aa  48.5  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
NC_006686  CND02320  vacuolar (H+)-ATPase subunit, putative  32 
 
 		 849 aa  47.4  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1725  V-type ATPase, 116 kDa subunit  30.77 
 
 		 767 aa  47  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0743  V-type ATPase 116 kDa subunit  31.87 
 
 		 766 aa  47  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0753  H+-ATPase subunit I-like protein  22.15 
 
 		 645 aa  47  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0763  V-type ATPase, 116 kDa subunit  30.68 
 
 		 765 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.27354  normal  0.871767 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  29.29 
 
 		 818 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>