45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1830 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1830  V-type ATPase 116 kDa subunit  100 
 
 
590 aa  1179    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  24.68 
 
 
604 aa  120  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.45 
 
 
622 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2896  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.77 
 
 
592 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0560963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3224  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.45 
 
 
592 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  22.87 
 
 
658 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.13 
 
 
651 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.33 
 
 
638 aa  96.3  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  27.86 
 
 
643 aa  96.3  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2052  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.21 
 
 
689 aa  95.9  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  23.96 
 
 
655 aa  93.6  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.68 
 
 
676 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  20.56 
 
 
646 aa  90.9  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.34 
 
 
618 aa  89.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  26.45 
 
 
686 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  26.45 
 
 
686 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  26.45 
 
 
689 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  25.85 
 
 
674 aa  84.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  26.93 
 
 
689 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.23 
 
 
637 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  26.57 
 
 
653 aa  77  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.91 
 
 
623 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  26.39 
 
 
648 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.89 
 
 
663 aa  73.9  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  25.87 
 
 
649 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  26.67 
 
 
649 aa  72  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  20.37 
 
 
646 aa  71.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.57 
 
 
643 aa  70.1  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  33.97 
 
 
628 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  22.56 
 
 
680 aa  67  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  22.96 
 
 
661 aa  65.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  25 
 
 
746 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.83 
 
 
712 aa  61.2  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.94 
 
 
695 aa  60.5  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.97 
 
 
658 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  22.68 
 
 
644 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0579  V-type ATP synthase subunit I  26.89 
 
 
649 aa  58.9  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.91284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0956  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.38 
 
 
668 aa  58.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  22.27 
 
 
659 aa  57.4  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  22.32 
 
 
705 aa  55.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  21.43 
 
 
458 aa  53.9  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.49 
 
 
726 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.89 
 
 
657 aa  50.8  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.38 
 
 
632 aa  50.4  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  19.54 
 
 
674 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>