65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3446 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  100 
 
 		 632 aa  1294    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.45 
 
 		 649 aa  349  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  33.39 
 
 		 618 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.28 
 
 		 458 aa  257  4e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.51 
 
 		 643 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  28.83 
 
 		 628 aa  206  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  33.54 
 
 		 943 aa  150  9e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  22.97 
 
 		 705 aa  149  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  26.24 
 
 		 648 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  26.36 
 
 		 649 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  26.67 
 
 		 676 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.4 
 
 		 637 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.34 
 
 		 659 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3458  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.95 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.66 
 
 		 643 aa  125  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.37 
 
 		 712 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.16 
 
 		 733 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.638629 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.12 
 
 		 695 aa  117  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  22.88 
 
 		 653 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  22.17 
 
 		 646 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0753  H+-ATPase subunit I-like protein  31.4 
 
 		 645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.48 
 
 		 726 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.31 
 
 		 638 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.95 
 
 		 623 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  23.77 
 
 		 646 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  21.58 
 
 		 644 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.93 
 
 		 749 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25 
 
 		 651 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.98 
 
 		 663 aa  99.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.35 
 
 		 835 aa  98.6  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.04 
 
 		 674 aa  97.4  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  21.15 
 
 		 658 aa  95.9  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.52 
 
 		 657 aa  94.7  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1376  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.18 
 
 		 757 aa  93.6  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  22.5 
 
 		 661 aa  92.8  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  22.96 
 
 		 655 aa  91.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  22.64 
 
 		 689 aa  90.5  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  24.31 
 
 		 674 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  23.9 
 
 		 686 aa  88.6  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  23.88 
 
 		 689 aa  89  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  23.73 
 
 		 686 aa  87.8  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  22.82 
 
 		 680 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0763  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.96 
 
 		 765 aa  79  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.27354  normal  0.871767 
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  24.79 
 
 		 604 aa  78.2  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.63 
 
 		 746 aa  77.4  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0956  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.8 
 
 		 668 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.38 
 
 		 658 aa  75.1  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.9 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0743  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.96 
 
 		 766 aa  72.4  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  25.65 
 
 		 818 aa  71.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.46 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.77 
 
 		 622 aa  69.3  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52299  V0 domain of vacuolar H+ATPase  20.9 
 
 		 791 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.303606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.15 
 
 		 619 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  25.58 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67737  vacuolar ATPase V0 domain subunit a  29.82 
 
 		 947 aa  62.4  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.508189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  32.43 
 
 		 842 aa  61.2  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02320  vacuolar (H+)-ATPase subunit, putative  27.93 
 
 		 849 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0549  V-type ATPase, 116 kDa subunit  33.98 
 
 		 765 aa  57  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  26.79 
 
 		 852 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  19.66 
 
 		 625 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1725  V-type ATPase, 116 kDa subunit  35.35 
 
 		 767 aa  51.6  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1693  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.77 
 
 		 699 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.606133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2052  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25 
 
 		 689 aa  47.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1737  H+-transporting ATP synthase subunit I (atpI), conjectural  37.33 
 
 		 81 aa  45.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>