58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1806 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  100 
 
 
604 aa  1232    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.77 
 
 
622 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  25.95 
 
 
649 aa  157  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  31.15 
 
 
651 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.64 
 
 
638 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  26.14 
 
 
648 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.25 
 
 
643 aa  148  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.67 
 
 
663 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.87 
 
 
676 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  27.94 
 
 
659 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.97 
 
 
657 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0579  V-type ATP synthase subunit I  23.47 
 
 
649 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.91284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  28.94 
 
 
646 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  27.02 
 
 
658 aa  124  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  27.03 
 
 
655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  26.08 
 
 
646 aa  122  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  28.54 
 
 
680 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  27.89 
 
 
686 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  27.89 
 
 
686 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  29.15 
 
 
689 aa  115  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  26.1 
 
 
653 aa  114  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  26.43 
 
 
674 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  30.46 
 
 
689 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.82 
 
 
618 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2052  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.24 
 
 
689 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1830  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.25 
 
 
590 aa  108  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3224  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.55 
 
 
592 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  26.96 
 
 
623 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.68 
 
 
712 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  27.99 
 
 
458 aa  99.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.35 
 
 
643 aa  99  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2896  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.17 
 
 
592 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0560963  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.63 
 
 
615 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.83 
 
 
658 aa  97.1  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0956  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.73 
 
 
668 aa  97.1  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.92 
 
 
649 aa  95.9  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  24.13 
 
 
644 aa  94.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.93 
 
 
615 aa  94  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  28.75 
 
 
661 aa  92.4  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.92 
 
 
625 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.62 
 
 
632 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  34.04 
 
 
637 aa  80.9  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.91 
 
 
726 aa  75.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  21.88 
 
 
943 aa  64.3  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  32.61 
 
 
619 aa  64.3  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.03 
 
 
628 aa  63.9  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  22.98 
 
 
705 aa  63.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.15 
 
 
835 aa  61.2  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1376  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.42 
 
 
757 aa  60.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.11 
 
 
749 aa  57  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  23.38 
 
 
842 aa  55.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1693  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.27 
 
 
699 aa  55.1  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.606133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.75 
 
 
695 aa  52.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 
782 aa  50.4  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.81 
 
 
746 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  30 
 
 
733 aa  48.9  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.638629 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  25.49 
 
 
818 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  24.68 
 
 
852 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>