66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2682 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  52.89 
 
 		 658 aa  721    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  56.55 
 
 		 653 aa  733    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  49.26 
 
 		 674 aa  646    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  100 
 
 		 655 aa  1325    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  49.48 
 
 		 661 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  32.8 
 
 		 646 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  33.24 
 
 		 644 aa  362  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  31.52 
 
 		 674 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.09 
 
 		 749 aa  273  9e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.5 
 
 		 726 aa  270  7e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1376  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.66 
 
 		 757 aa  253  8.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.2 
 
 		 733 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.638629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  30.74 
 
 		 637 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  28.25 
 
 		 659 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.34 
 
 		 663 aa  171  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  27.78 
 
 		 686 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  28.16 
 
 		 689 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  27.78 
 
 		 686 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.03 
 
 		 651 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  29.36 
 
 		 680 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  28.31 
 
 		 689 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.6 
 
 		 623 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  25.2 
 
 		 643 aa  150  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  26.21 
 
 		 676 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  28.28 
 
 		 649 aa  144  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  26.9 
 
 		 648 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.35 
 
 		 638 aa  139  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.57 
 
 		 712 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  31.54 
 
 		 625 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.83 
 
 		 746 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  26.61 
 
 		 604 aa  120  9e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.43 
 
 		 615 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.05 
 
 		 615 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.31 
 
 		 622 aa  114  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.05 
 
 		 643 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.3 
 
 		 618 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  21.35 
 
 		 649 aa  108  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.43 
 
 		 658 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.39 
 
 		 458 aa  103  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0956  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.1 
 
 		 668 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  25 
 
 		 646 aa  103  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.88 
 
 		 657 aa  103  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0579  V-type ATP synthase subunit I  25.35 
 
 		 649 aa  98.6  3e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.91284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  29.87 
 
 		 619 aa  97.1  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3224  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.69 
 
 		 592 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.13 
 
 		 632 aa  94.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2052  V-type ATPase, 116 kDa subunit  27.31 
 
 		 689 aa  93.6  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2896  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.04 
 
 		 592 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0560963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1830  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.3 
 
 		 590 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25 
 
 		 628 aa  75.1  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02320  vacuolar (H+)-ATPase subunit, putative  24.44 
 
 		 849 aa  71.6  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  22.77 
 
 		 943 aa  67.8  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52299  V0 domain of vacuolar H+ATPase  29.32 
 
 		 791 aa  66.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.303606 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.43 
 
 		 835 aa  62.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  21.71 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  22.84 
 
 		 842 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1693  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.21 
 
 		 699 aa  58.5  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.606133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.51 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  25.24 
 
 		 852 aa  54.3  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  28.43 
 
 		 818 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0753  H+-ATPase subunit I-like protein  27.85 
 
 		 645 aa  52.4  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67737  vacuolar ATPase V0 domain subunit a  35.94 
 
 		 947 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.508189  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 782 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3458  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.17 
 
 		 469 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0763  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.16 
 
 		 765 aa  47  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.27354  normal  0.871767 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0549  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.88 
 
 		 765 aa  43.9  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>