54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52299 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  49.7 
 
 
852 aa  817    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52299  V0 domain of vacuolar H+ATPase  100 
 
 
791 aa  1637    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.303606 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67737  vacuolar ATPase V0 domain subunit a  46.66 
 
 
947 aa  778    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.508189  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02320  vacuolar (H+)-ATPase subunit, putative  42.57 
 
 
849 aa  683    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  43.18 
 
 
782 aa  557  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  36.94 
 
 
842 aa  515  1e-144  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  32.77 
 
 
818 aa  421  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.28 
 
 
632 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  29.32 
 
 
655 aa  74.3  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  21.44 
 
 
649 aa  72  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  21.49 
 
 
705 aa  69.3  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.05 
 
 
835 aa  69.7  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  25 
 
 
644 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  22.08 
 
 
646 aa  66.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  20.3 
 
 
458 aa  65.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.39 
 
 
749 aa  63.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  28.67 
 
 
628 aa  63.9  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.85 
 
 
943 aa  62.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.66 
 
 
643 aa  63.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  23.48 
 
 
680 aa  62.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  23.71 
 
 
653 aa  62  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  24.55 
 
 
674 aa  61.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  26.96 
 
 
658 aa  61.2  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.23 
 
 
618 aa  55.1  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.22 
 
 
733 aa  55.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.638629 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.63 
 
 
695 aa  55.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.99 
 
 
622 aa  54.3  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  27.68 
 
 
646 aa  52  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.07 
 
 
638 aa  51.6  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  35 
 
 
689 aa  50.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  22.99 
 
 
637 aa  50.8  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  34 
 
 
686 aa  50.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3458  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.77 
 
 
469 aa  50.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  34 
 
 
686 aa  50.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  33.66 
 
 
689 aa  50.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0549  V-type ATPase, 116 kDa subunit  27.62 
 
 
765 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  20.92 
 
 
658 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  29 
 
 
651 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  28.1 
 
 
661 aa  49.7  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.17 
 
 
674 aa  48.9  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  31 
 
 
676 aa  48.1  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0763  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.19 
 
 
765 aa  47.8  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.27354  normal  0.871767 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1693  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.22 
 
 
699 aa  47  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.606133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.26 
 
 
726 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1376  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.43 
 
 
757 aa  46.6  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  28.7 
 
 
649 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  28.7 
 
 
648 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  33.94 
 
 
615 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  34.02 
 
 
663 aa  45.4  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.77 
 
 
623 aa  45.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  35.16 
 
 
619 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  36.56 
 
 
615 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1725  V-type ATPase, 116 kDa subunit  29.13 
 
 
767 aa  44.7  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0743  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.13 
 
 
766 aa  43.9  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>