67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1106 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  100 
 
 
618 aa  1244    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.93 
 
 
643 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.25 
 
 
649 aa  301  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  33.39 
 
 
632 aa  284  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.83 
 
 
458 aa  230  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  28.06 
 
 
628 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  31.57 
 
 
943 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  24.47 
 
 
705 aa  145  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.26 
 
 
643 aa  143  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  22.97 
 
 
649 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  22.97 
 
 
648 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.34 
 
 
695 aa  134  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.95 
 
 
651 aa  134  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  27.02 
 
 
680 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.89 
 
 
659 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  24.23 
 
 
653 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3458  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.19 
 
 
469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.78 
 
 
663 aa  128  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  26.33 
 
 
676 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.18 
 
 
712 aa  120  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  24.15 
 
 
658 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  24.54 
 
 
689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.51 
 
 
835 aa  118  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1693  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.94 
 
 
699 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.606133 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  24.1 
 
 
686 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  24.53 
 
 
686 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  27.03 
 
 
657 aa  108  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0753  H+-ATPase subunit I-like protein  30.19 
 
 
645 aa  107  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.07 
 
 
638 aa  106  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  24.96 
 
 
646 aa  105  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  24.12 
 
 
689 aa  104  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  22.89 
 
 
655 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.04 
 
 
622 aa  99  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  25.82 
 
 
604 aa  98.6  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.84 
 
 
749 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.35 
 
 
726 aa  96.3  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.82 
 
 
637 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  22.56 
 
 
646 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.49 
 
 
674 aa  93.6  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.12 
 
 
625 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0549  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.83 
 
 
765 aa  84.7  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  25.95 
 
 
623 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  23.25 
 
 
674 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  19.52 
 
 
644 aa  82  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.38 
 
 
615 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.77 
 
 
615 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0743  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.65 
 
 
766 aa  79.3  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.42 
 
 
733 aa  79.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.638629 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.6 
 
 
746 aa  75.5  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3224  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.07 
 
 
592 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1725  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.07 
 
 
767 aa  73.9  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2896  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.65 
 
 
592 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0560963  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0763  V-type ATPase, 116 kDa subunit  27.53 
 
 
765 aa  71.2  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.27354  normal  0.871767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1830  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.71 
 
 
590 aa  70.1  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  28.18 
 
 
818 aa  65.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1376  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.04 
 
 
757 aa  65.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.33 
 
 
619 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  22.56 
 
 
661 aa  64.3  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  22.76 
 
 
852 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  26 
 
 
782 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
NC_006686  CND02320  vacuolar (H+)-ATPase subunit, putative  22.33 
 
 
849 aa  58.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.66 
 
 
658 aa  56.2  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0956  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.73 
 
 
668 aa  53.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  34.26 
 
 
842 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67737  vacuolar ATPase V0 domain subunit a  29.23 
 
 
947 aa  50.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.508189  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2052  V-type ATPase, 116 kDa subunit  21.3 
 
 
689 aa  50.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52299  V0 domain of vacuolar H+ATPase  24.84 
 
 
791 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.303606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>