66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3077 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  100 
 
 		 676 aa  1389    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  32.55 
 
 		 651 aa  350  4e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.51 
 
 		 643 aa  303  9e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  35.32 
 
 		 638 aa  248  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  27.41 
 
 		 648 aa  238  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  27.12 
 
 		 649 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.98 
 
 		 663 aa  219  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  27.25 
 
 		 646 aa  204  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  29.7 
 
 		 659 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  27.98 
 
 		 686 aa  198  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  28.2 
 
 		 686 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  24.93 
 
 		 689 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.17 
 
 		 657 aa  194  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  26.53 
 
 		 689 aa  192  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  26.94 
 
 		 646 aa  172  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  24.05 
 
 		 680 aa  169  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.22 
 
 		 712 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  23.72 
 
 		 644 aa  151  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  26.95 
 
 		 653 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  28.29 
 
 		 674 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  26.58 
 
 		 658 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.95 
 
 		 637 aa  145  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.05 
 
 		 643 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  26.21 
 
 		 655 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  29.13 
 
 		 604 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.09 
 
 		 623 aa  134  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.67 
 
 		 632 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.28 
 
 		 674 aa  127  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.33 
 
 		 618 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  27.49 
 
 		 661 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  27.53 
 
 		 649 aa  125  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.38 
 
 		 615 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.19 
 
 		 615 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1553  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.75 
 
 		 622 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  22.56 
 
 		 705 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2052  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.54 
 
 		 689 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.32 
 
 		 726 aa  102  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.04 
 
 		 628 aa  99.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.84 
 
 		 733 aa  95.5  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.638629 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  24.07 
 
 		 458 aa  95.1  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0579  V-type ATP synthase subunit I  23.43 
 
 		 649 aa  93.2  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.91284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.3 
 
 		 658 aa  90.1  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  22.57 
 
 		 749 aa  89.7  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1376  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.46 
 
 		 757 aa  84  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1693  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.92 
 
 		 699 aa  82  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.606133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0956  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.13 
 
 		 668 aa  80.5  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1830  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.68 
 
 		 590 aa  76.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.71 
 
 		 695 aa  73.9  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  32 
 
 		 625 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  20.4 
 
 		 943 aa  68.9  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  22.97 
 
 		 619 aa  67.8  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.41 
 
 		 835 aa  64.3  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3224  V-type ATPase 116 kDa subunit  19.2 
 
 		 592 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2896  V-type ATPase 116 kDa subunit  19.69 
 
 		 592 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0560963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0743  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.81 
 
 		 766 aa  60.1  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.89 
 
 		 746 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0549  V-type ATPase, 116 kDa subunit  30.66 
 
 		 765 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3458  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.34 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0763  V-type ATPase, 116 kDa subunit  30.85 
 
 		 765 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.27354  normal  0.871767 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1725  V-type ATPase, 116 kDa subunit  31.91 
 
 		 767 aa  52.4  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  31.73 
 
 		 842 aa  51.2  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02320  vacuolar (H+)-ATPase subunit, putative  35.29 
 
 		 849 aa  50.8  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52299  V0 domain of vacuolar H+ATPase  31 
 
 		 791 aa  48.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.303606 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67737  vacuolar ATPase V0 domain subunit a  32.65 
 
 		 947 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.508189  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  32.32 
 
 		 852 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  29.9 
 
 		 818 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>