64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3458 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3458  V-type ATPase 116 kDa subunit  100 
 
 
469 aa  898    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1106  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.68 
 
 
618 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3446  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.71 
 
 
632 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19440  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.08 
 
 
649 aa  150  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1015  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.16 
 
 
458 aa  143  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0521  V-type ATPase 116 kDa subunit  32.45 
 
 
643 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2087  V-type ATPase, 116 kDa subunit  32.6 
 
 
628 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781263  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0337  V-type ATPase, 116 kDa subunit  30.32 
 
 
943 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3077  H(+)-transporting two-sector ATPase  21.11 
 
 
676 aa  93.2  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.428671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1764  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.67 
 
 
637 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435017  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1775  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.93 
 
 
659 aa  91.3  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2262  V-type ATPase, 116 kDa subunit  22.48 
 
 
651 aa  89.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.181857  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0853  V-type ATPase 116 kDa subunit  29.5 
 
 
663 aa  87.8  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.844928  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1914  V-type ATP synthase subunit I  25.64 
 
 
705 aa  84.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000116977  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1238  V-type ATP synthase subunit I  24.62 
 
 
646 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1432  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.32 
 
 
726 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2350  V-type ATP synthase subunit I  28.49 
 
 
658 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.356369 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0282  V-type ATP synthase subunit I  26.91 
 
 
653 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.788334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2369  H(+)-transporting two-sector ATPase  25.8 
 
 
643 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2682  V-type ATP synthase subunit I  24.34 
 
 
655 aa  73.6  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115489  normal  0.153118 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0753  H+-ATPase subunit I-like protein  31.37 
 
 
645 aa  71.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1267  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.43 
 
 
712 aa  68.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0391  V-type ATP synthase subunit I  25.59 
 
 
644 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1380  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.31 
 
 
835 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.897752  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1506  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.36 
 
 
657 aa  67.4  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0251  V-type ATPase 116 kDa subunit  21.01 
 
 
638 aa  63.5  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67737  vacuolar ATPase V0 domain subunit a  31.3 
 
 
947 aa  60.5  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.508189  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0276  V-type ATPase 116 kDa subunit  27.81 
 
 
733 aa  60.5  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.638629 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0554  V-type ATP synthase subunit I  24.79 
 
 
689 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1693  V-type ATPase 116 kDa subunit  23.25 
 
 
699 aa  59.3  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.606133 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0293  V-type ATP synthase subunit I  24.52 
 
 
686 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.763143  normal  0.565674 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2768  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.91 
 
 
615 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0200984  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1614  V-type ATPase, 116 kDa subunit  34.21 
 
 
674 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.167077  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1620  V-type ATP synthase subunit I  24.52 
 
 
686 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0579  V-type ATP synthase subunit I  23.88 
 
 
649 aa  58.2  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.91284  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28794  predicted protein  33.88 
 
 
818 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0418  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.43 
 
 
623 aa  57  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1691  Sodium-transporting two-sector ATPase  27.65 
 
 
646 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02320  vacuolar (H+)-ATPase subunit, putative  30.77 
 
 
849 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0362  V-type ATP synthase subunit I  25.34 
 
 
689 aa  55.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.083304  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46292  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  27.89 
 
 
842 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0060  V-type ATP synthase subunit I  26.02 
 
 
680 aa  53.5  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3224  V-type ATPase 116 kDa subunit  25.93 
 
 
592 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52299  V0 domain of vacuolar H+ATPase  30.11 
 
 
791 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.303606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1197  V-type ATPase, 116 kDa subunit  37.89 
 
 
619 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05606  vacuolar ATPase 98 kDa subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11300)  30.58 
 
 
852 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0629055  normal  0.172509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1448  V-type ATPase 116 kDa subunit  24.92 
 
 
658 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248311  normal  0.5729 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0549  V-type ATPase, 116 kDa subunit  38.46 
 
 
765 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0763  V-type ATPase, 116 kDa subunit  40 
 
 
765 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.27354  normal  0.871767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2673  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.52 
 
 
615 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3348  V-type ATPase 116 kDa subunit  31.9 
 
 
749 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1178  V-type ATP synthase subunit I  27.78 
 
 
674 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0337155  normal  0.692969 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05083  conserved hypothetical protein  28.29 
 
 
782 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782503  normal  0.739773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1627  V-type ATPase 116 kDa subunit  38.61 
 
 
695 aa  49.3  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.832339  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1725  V-type ATPase, 116 kDa subunit  35.56 
 
 
767 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0743  V-type ATPase 116 kDa subunit  36.67 
 
 
766 aa  47.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1217  V-type ATP synthase subunit I  24.81 
 
 
661 aa  47.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000138447  normal  0.236673 
 
 
-
 
NC_002950  PG1806  v-type ATPase, subunit I  23.69 
 
 
604 aa  46.6  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1614  V-type ATP synthase subunit I  25.08 
 
 
648 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2896  V-type ATPase 116 kDa subunit  26.17 
 
 
592 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0560963  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1276  V-type ATPase 116 kDa subunit  30.91 
 
 
746 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2569  V-type ATPase 116 kDa subunit  28.61 
 
 
625 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.334556  normal  0.496883 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1895  V-type ATP synthase subunit I  24.18 
 
 
649 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1376  V-type ATPase 116 kDa subunit  32.71 
 
 
757 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>