More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf694 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf694  ribosomal protein S18  100 
 
 
130 aa  262  1e-69  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  52.24 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  40.48 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  41.41 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  55 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  48.65 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  48.75 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  46.97 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  54.84 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  47.56 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  45.45 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  48.48 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09983  ribosomal protein S18  52.38 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.596989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  44.16 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  51.52 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  46.27 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  49.32 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  47.76 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
77 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  44.3 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  48.75 
 
 
75 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  46.48 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  50 
 
 
87 aa  70.1  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 
83 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  48.44 
 
 
76 aa  69.7  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  48.53 
 
 
90 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  53.97 
 
 
76 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  51.47 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  50 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  44.16 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  51.61 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  48.05 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  50 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  50 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  44.78 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  49.25 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  50 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  50.79 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  47.5 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  45.07 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0043  ribosomal protein S18  40 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0560  30S ribosomal protein S18  48.53 
 
 
76 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.152801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  47.5 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  47.5 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  47.5 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  47.5 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  48.39 
 
 
78 aa  67.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  48.48 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  40 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  48.44 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  51.95 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  45.21 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  46.25 
 
 
75 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  45.45 
 
 
75 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  46.77 
 
 
78 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  48.44 
 
 
90 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  43.66 
 
 
106 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  46.25 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  46.25 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  46.25 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  47.76 
 
 
78 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  46.25 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  46.25 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  46.25 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  46.25 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  46.25 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  46.25 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  48.05 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  48.05 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  44.16 
 
 
76 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  48.05 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  48.05 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  41.56 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  48.05 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  48.05 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  48.05 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  48.05 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.998059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>