108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03309 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03309  Peptide methionine sulfoxide reductase msrA 2  100 
 
 		 111 aa  229  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0746  peptide methionine sulfoxide reductase  81 
 
 		 195 aa  176  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  72 
 
 		 197 aa  158  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  64.65 
 
 		 196 aa  147  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 212 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  45.54 
 
 		 212 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  46.94 
 
 		 191 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  48.96 
 
 		 242 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  46 
 
 		 208 aa  93.6  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  44.9 
 
 		 191 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  49.48 
 
 		 208 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  48.48 
 
 		 198 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  47.47 
 
 		 200 aa  88.2  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1184  peptide methionine sulfoxide reductase  43.88 
 
 		 203 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  46.53 
 
 		 211 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  49.49 
 
 		 323 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  43.69 
 
 		 368 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  43.88 
 
 		 214 aa  84.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.45 
 
 		 416 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0340  peptide methionine sulfoxide reductase  40.18 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.663194  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17601  peptide methionine sulfoxide reductase  39.39 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2955  peptide methionine sulfoxide reductase  40.57 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  45.1 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0904  methionine sulfoxide reductase A  39.39 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68103  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  45.45 
 
 		 416 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  43.3 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  45.26 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15331  peptide methionine sulfoxide reductase  40.59 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  39.42 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  43 
 
 		 397 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15191  peptide methionine sulfoxide reductase  40.59 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0163481  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  42.42 
 
 		 380 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 381 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13871  peptide methionine sulfoxide reductase  38.61 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.370801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  43.75 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  41.41 
 
 		 380 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1431  peptide methionine sulfoxide reductase  37.62 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3242  peptide methionine sulfoxide reductase  39.29 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  43.88 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05541  peptide methionine sulfoxide reductase  36.63 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  41.41 
 
 		 328 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  42.16 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  42 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  42.16 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  42.16 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  36.73 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14941  peptide methionine sulfoxide reductase  38.61 
 
 		 201 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.579151  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  35.64 
 
 		 209 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  42.16 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  42.42 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  46.25 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  41.18 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  41.18 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  41.18 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  41.18 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  39.18 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  40.62 
 
 		 321 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  41.18 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.58 
 
 		 321 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  40 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  40 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3468  peptide methionine sulfoxide reductase  38.39 
 
 		 226 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  36.63 
 
 		 212 aa  67  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.58 
 
 		 321 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  39.8 
 
 		 394 aa  67  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  39.58 
 
 		 321 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  39.58 
 
 		 321 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.21 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.21 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  39.58 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.58 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  40.2 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  39.58 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  37.11 
 
 		 353 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  37 
 
 		 170 aa  63.5  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  38.78 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2436  peptide methionine sulfoxide reductase  36.08 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.228717  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  41.24 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  38.38 
 
 		 260 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  40.21 
 
 		 351 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1422  methionine sulfoxide reductase A  37.86 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1450  methionine sulfoxide reductase A  37.86 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.58381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  36.17 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  35.29 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  37.8 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  37.5 
 
 		 201 aa  53.9  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  37.5 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  42.31 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1596  peptide methionine sulfoxide reductase  35.42 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  35.05 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.33 
 
 		 306 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2288  methionine sulfoxide reductase A  36.71 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17362  predicted protein  31.73 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.937042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  36.84 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  36.9 
 
 		 322 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  37.35 
 
 		 168 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  34.72 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  35.8 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>