More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01299 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01299  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 375 aa  766    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  24.01 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 		 822 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.57 
 
 		 857 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 819 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 818 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  25.59 
 
 		 820 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  24.4 
 
 		 820 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  24.4 
 
 		 820 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.4 
 
 		 820 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.4 
 
 		 820 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.4 
 
 		 856 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.4 
 
 		 856 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 821 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  24.4 
 
 		 820 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02930  glycosyltransferase  26.42 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 821 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  21.67 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  20.91 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  28.28 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1197  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.788986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.41 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.92 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.9 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  27.94 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  27.94 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  27.94 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  22.35 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 828 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1001  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  23.21 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  27.94 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  27.45 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0292  glycosyl transferase, group 1  20.94 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 477 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  21.71 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 414 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3204  glycosyl transferase, group 1  21.87 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0738  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  19.23 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.83 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4067  glycosyl transferase  25.93 
 
 		 1076 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  21.11 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  21.75 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  26.47 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  21.05 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0725  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.167253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.91 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.67 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  25 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  29.35 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.3 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0588  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.147569  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  21.08 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>