More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3642 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
408 aa  803    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  78.19 
 
 
410 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  78.87 
 
 
405 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0115  8-amino-7-oxononanoate synthase  64.62 
 
 
406 aa  454  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0148  8-amino-7-oxononanoate synthase  63.84 
 
 
408 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2811  8-amino-7-oxononanoate synthase  64.41 
 
 
410 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.65 
 
 
394 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.9 
 
 
394 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0339  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.85 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.45 
 
 
396 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.94 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.94 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.94 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.94 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.94 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.94 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.94 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.68 
 
 
394 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.34 
 
 
387 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1478  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.14 
 
 
416 aa  385  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0815886  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2844  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.89 
 
 
445 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956659  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1372  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.75 
 
 
415 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.134715  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1436  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.72 
 
 
415 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.469568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2981  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.15 
 
 
471 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6276  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.89 
 
 
400 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2318  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.97 
 
 
406 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2932  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.97 
 
 
406 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0168  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.51 
 
 
411 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2947  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.72 
 
 
406 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.4 
 
 
411 aa  364  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.14 
 
 
386 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0373  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.25 
 
 
394 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850548  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.13 
 
 
387 aa  343  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.88 
 
 
392 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.93 
 
 
397 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.36 
 
 
394 aa  335  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.37 
 
 
399 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.32 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.35 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.32 
 
 
396 aa  325  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.26 
 
 
401 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.05 
 
 
389 aa  319  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0898  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.55 
 
 
405 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.76 
 
 
401 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.98 
 
 
396 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.11 
 
 
387 aa  315  9e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.96 
 
 
392 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.85 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.61 
 
 
391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.47 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.85 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.82 
 
 
397 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.36 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0320  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.67 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569428  normal  0.0137609 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3843  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.25 
 
 
412 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.64 
 
 
391 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.72 
 
 
390 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.8 
 
 
392 aa  282  9e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  45 
 
 
385 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.21 
 
 
384 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.84 
 
 
384 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.29 
 
 
389 aa  279  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.93 
 
 
384 aa  279  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.21 
 
 
384 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.37 
 
 
384 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.37 
 
 
384 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.52 
 
 
391 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.05 
 
 
391 aa  275  9e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.09 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.09 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  46.09 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.05 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.09 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.75 
 
 
390 aa  272  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.05 
 
 
389 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.97 
 
 
386 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.37 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.37 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.37 
 
 
385 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.78 
 
 
384 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.26 
 
 
385 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.37 
 
 
385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.46 
 
 
384 aa  269  7e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.74 
 
 
396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.96 
 
 
393 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.43 
 
 
384 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.33 
 
 
384 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1720  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.36 
 
 
382 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0359969  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.32 
 
 
392 aa  261  1e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.03 
 
 
385 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.9 
 
 
396 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.25 
 
 
388 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.64 
 
 
383 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.64 
 
 
383 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  37.56 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.9 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.7 
 
 
390 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.54 
 
 
382 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.04 
 
 
392 aa  250  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.64 
 
 
395 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>