More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0115 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0115  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 406 aa  795    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0148  8-amino-7-oxononanoate synthase  79.66 
 
 		 408 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.09 
 
 		 410 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  64.62 
 
 		 408 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  65.84 
 
 		 405 aa  461  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2811  8-amino-7-oxononanoate synthase  65.36 
 
 		 410 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.41 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.15 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1478  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.98 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0815886  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0339  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.18 
 
 		 394 aa  391  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1436  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.04 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.469568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.18 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1372  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.07 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.134715  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.26 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.26 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.26 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.26 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.26 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.26 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.19 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  60 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.63 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.4 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0168  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.27 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2318  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.15 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2932  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.15 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2947  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.41 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2844  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.41 
 
 		 445 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956659  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2981  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.77 
 
 		 471 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0373  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.9 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6276  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.13 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.25 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.81 
 
 		 386 aa  342  8e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 		 396 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  51 
 
 		 401 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.39 
 
 		 389 aa  338  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.16 
 
 		 390 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.75 
 
 		 401 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.28 
 
 		 397 aa  336  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.5 
 
 		 396 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.26 
 
 		 390 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.62 
 
 		 392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.12 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.36 
 
 		 396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.92 
 
 		 397 aa  325  7e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.72 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.26 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.14 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.4 
 
 		 391 aa  318  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.15 
 
 		 387 aa  316  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.14 
 
 		 405 aa  316  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.84 
 
 		 387 aa  315  9e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3843  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.87 
 
 		 412 aa  308  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.12 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.26 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0898  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.79 
 
 		 405 aa  306  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0320  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.04 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569428  normal  0.0137609 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.6 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.71 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.07 
 
 		 385 aa  285  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.74 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.79 
 
 		 390 aa  282  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.99 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.99 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.42 
 
 		 384 aa  279  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.85 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.85 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.7 
 
 		 384 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.13 
 
 		 384 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.13 
 
 		 384 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  46.13 
 
 		 384 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.13 
 
 		 384 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.13 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 		 392 aa  276  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.79 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.56 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.56 
 
 		 385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.23 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.56 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.81 
 
 		 391 aa  272  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.37 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.09 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.48 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.97 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.56 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.04 
 
 		 383 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  39.66 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.06 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.57 
 
 		 384 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.62 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.54 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02210  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.45 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63523  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0934  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.54 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  37 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1041  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.12 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660772  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0962  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.44 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0636992  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.64 
 
 		 392 aa  256  6e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.58 
 
 		 401 aa  256  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.58 
 
 		 401 aa  255  8e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02875  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.31 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>