More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1436 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1478  8-amino-7-oxononanoate synthase  85.19 
 
 
416 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0815886  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1436  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
415 aa  824    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.469568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1372  8-amino-7-oxononanoate synthase  96.14 
 
 
415 aa  742    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.134715  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.73 
 
 
410 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2811  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.8 
 
 
410 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.72 
 
 
408 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0115  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.04 
 
 
406 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.61 
 
 
405 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0148  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.01 
 
 
408 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.17 
 
 
394 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.42 
 
 
394 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.73 
 
 
394 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0339  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.96 
 
 
394 aa  359  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.28 
 
 
396 aa  359  5e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.22 
 
 
394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.22 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.22 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.22 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.22 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.22 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.22 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.04 
 
 
411 aa  352  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0168  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.25 
 
 
411 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2947  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.79 
 
 
406 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0373  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.71 
 
 
394 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850548  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2318  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.78 
 
 
406 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2932  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.78 
 
 
406 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.63 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6276  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.42 
 
 
400 aa  342  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2844  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.05 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956659  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2981  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.8 
 
 
471 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.88 
 
 
387 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.11 
 
 
386 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.91 
 
 
397 aa  322  8e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.52 
 
 
403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.01 
 
 
396 aa  319  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.65 
 
 
405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.08 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0898  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.63 
 
 
405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.75 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.5 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.62 
 
 
396 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.58 
 
 
392 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.95 
 
 
396 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.35 
 
 
391 aa  296  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.65 
 
 
391 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.49 
 
 
390 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.83 
 
 
390 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.51 
 
 
389 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.58 
 
 
390 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.09 
 
 
391 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0320  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.75 
 
 
386 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569428  normal  0.0137609 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3843  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.61 
 
 
412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.96 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.92 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.49 
 
 
390 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.15 
 
 
401 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.3 
 
 
392 aa  282  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.25 
 
 
389 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.05 
 
 
391 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  44.14 
 
 
395 aa  275  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.57 
 
 
386 aa  275  8e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.44 
 
 
385 aa  269  8e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.57 
 
 
389 aa  269  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.73 
 
 
396 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.49 
 
 
390 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.74 
 
 
383 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.01 
 
 
399 aa  259  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.9 
 
 
393 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.98 
 
 
395 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.53 
 
 
384 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.35 
 
 
384 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.74 
 
 
392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.8 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.35 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.66 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.17 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.35 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.01 
 
 
391 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.96 
 
 
391 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.8 
 
 
384 aa  252  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1346  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.16 
 
 
392 aa  252  9.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.0485323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.13 
 
 
392 aa  252  9.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.8 
 
 
384 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.99 
 
 
383 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.8 
 
 
384 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  43.8 
 
 
384 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.8 
 
 
384 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.13 
 
 
391 aa  250  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.92 
 
 
393 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.05 
 
 
390 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.05 
 
 
501 aa  249  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.1 
 
 
383 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  35.77 
 
 
395 aa  247  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.03 
 
 
385 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  39.29 
 
 
393 aa  247  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1041  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.61 
 
 
384 aa  246  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660772  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0934  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.61 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.31 
 
 
385 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.31 
 
 
385 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>