More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2844 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6276  8-amino-7-oxononanoate synthase  95.2 
 
 
400 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2844  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
445 aa  871    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956659  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2981  8-amino-7-oxononanoate synthase  97.74 
 
 
471 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2318  8-amino-7-oxononanoate synthase  94.47 
 
 
406 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2932  8-amino-7-oxononanoate synthase  94.47 
 
 
406 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2947  8-amino-7-oxononanoate synthase  95 
 
 
406 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  86.2 
 
 
394 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  85.94 
 
 
394 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  86.2 
 
 
394 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  86.2 
 
 
394 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  86.2 
 
 
394 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  86.2 
 
 
394 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  86.2 
 
 
394 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0339  8-amino-7-oxononanoate synthase  85.38 
 
 
394 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0373  8-amino-7-oxononanoate synthase  91.03 
 
 
394 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850548  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  77.86 
 
 
394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  75.45 
 
 
394 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  77.08 
 
 
394 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.89 
 
 
408 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.1 
 
 
410 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2811  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.9 
 
 
410 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0115  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.41 
 
 
406 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0168  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.26 
 
 
411 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1478  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.74 
 
 
416 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0815886  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.11 
 
 
396 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.65 
 
 
405 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1372  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.75 
 
 
415 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.134715  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.87 
 
 
387 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1436  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.05 
 
 
415 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.469568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.1 
 
 
411 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0148  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.39 
 
 
408 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.51 
 
 
396 aa  352  7e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.64 
 
 
405 aa  349  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3843  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.26 
 
 
412 aa  344  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.02 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.56 
 
 
397 aa  339  5.9999999999999996e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.74 
 
 
386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0898  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.8 
 
 
405 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.09 
 
 
394 aa  334  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.11 
 
 
387 aa  316  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.77 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.42 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.21 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.74 
 
 
401 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.19 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.47 
 
 
401 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.21 
 
 
387 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.6 
 
 
391 aa  299  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.85 
 
 
396 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.56 
 
 
390 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.41 
 
 
399 aa  295  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.95 
 
 
396 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.14 
 
 
391 aa  293  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0320  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.84 
 
 
386 aa  292  8e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569428  normal  0.0137609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.32 
 
 
390 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.24 
 
 
390 aa  292  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.43 
 
 
389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.2 
 
 
385 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.2 
 
 
385 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.93 
 
 
392 aa  286  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.2 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.29 
 
 
385 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.92 
 
 
385 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.74 
 
 
389 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.56 
 
 
384 aa  282  8.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.36 
 
 
389 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.89 
 
 
391 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.57 
 
 
384 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.53 
 
 
384 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.29 
 
 
384 aa  279  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.53 
 
 
384 aa  279  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.29 
 
 
384 aa  279  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  46.29 
 
 
384 aa  279  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.29 
 
 
384 aa  279  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.53 
 
 
384 aa  279  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.29 
 
 
384 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.56 
 
 
390 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.57 
 
 
384 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.86 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.9 
 
 
385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.97 
 
 
383 aa  273  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.31 
 
 
396 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.08 
 
 
384 aa  272  7e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.59 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.61 
 
 
393 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.73 
 
 
391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.54 
 
 
385 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.25 
 
 
384 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.27 
 
 
386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.69 
 
 
383 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0934  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.4 
 
 
384 aa  259  8e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.13 
 
 
396 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.69 
 
 
383 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1041  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.14 
 
 
384 aa  256  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.24 
 
 
388 aa  257  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.56 
 
 
382 aa  256  7e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.28 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.54 
 
 
384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.82 
 
 
398 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3602  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.82 
 
 
398 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>