More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1372 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1478  8-amino-7-oxononanoate synthase  84.58 
 
 		 416 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0815886  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1372  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 415 aa  827    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.134715  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1436  8-amino-7-oxononanoate synthase  96.14 
 
 		 415 aa  737    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.469568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.97 
 
 		 410 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.75 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2811  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.31 
 
 		 410 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0115  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.07 
 
 		 406 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0148  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.61 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.12 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.79 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0339  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.96 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.9 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.01 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.47 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.47 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.47 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.47 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.47 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.47 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.47 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.73 
 
 		 394 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.38 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.04 
 
 		 411 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0168  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.75 
 
 		 411 aa  354  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0373  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.96 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2947  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.04 
 
 		 406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2318  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.04 
 
 		 406 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2932  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.04 
 
 		 406 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6276  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.42 
 
 		 400 aa  349  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2844  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.93 
 
 		 445 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956659  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2981  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.05 
 
 		 471 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.63 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.67 
 
 		 386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.9 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.26 
 
 		 396 aa  325  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.12 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.25 
 
 		 403 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.09 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.37 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  51 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.26 
 
 		 387 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.91 
 
 		 396 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0898  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.73 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.38 
 
 		 392 aa  305  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.1 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.57 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.03 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.17 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.59 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.9 
 
 		 391 aa  298  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.95 
 
 		 401 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.11 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.25 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.44 
 
 		 387 aa  292  9e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.09 
 
 		 391 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.34 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3843  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.61 
 
 		 412 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.32 
 
 		 391 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0320  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.64 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569428  normal  0.0137609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  45.02 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.5 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.11 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.08 
 
 		 385 aa  275  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.57 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.57 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.73 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.48 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.48 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.41 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.9 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.77 
 
 		 399 aa  262  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.39 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.9 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  40.54 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.35 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.9 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.33 
 
 		 392 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.35 
 
 		 384 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.35 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.53 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.35 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  44.35 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  40.22 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  40.45 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.35 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1346  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.89 
 
 		 392 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.0485323 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.35 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.72 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.36 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.74 
 
 		 392 aa  256  5e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.87 
 
 		 390 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.61 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.53 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  40.11 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  36.25 
 
 		 395 aa  252  9.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.27 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.8 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1041  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.89 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660772  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.58 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0934  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.89 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>