More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2576 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  97.66 
 
 		 384 aa  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  97.92 
 
 		 384 aa  704    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  97.4 
 
 		 384 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  97.66 
 
 		 384 aa  702    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  99.48 
 
 		 384 aa  777    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 384 aa  782    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  97.66 
 
 		 384 aa  702    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  95.57 
 
 		 384 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  97.66 
 
 		 384 aa  702    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  79.95 
 
 		 385 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  79.95 
 
 		 385 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  79.95 
 
 		 385 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  79.95 
 
 		 385 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  79.69 
 
 		 385 aa  597  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  72.92 
 
 		 384 aa  539  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.4 
 
 		 385 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  67.97 
 
 		 384 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.67 
 
 		 382 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  65.88 
 
 		 385 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1312  8-amino-7-oxononanoate synthase  67.72 
 
 		 383 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2930  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.06 
 
 		 383 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1426  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.06 
 
 		 383 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2843  8-amino-7-oxononanoate synthase  66.06 
 
 		 383 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.07 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.92 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.48 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.2 
 
 		 383 aa  388  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.32 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.3 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.73 
 
 		 403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.42 
 
 		 397 aa  328  8e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.99 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.66 
 
 		 396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.4 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.53 
 
 		 401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.99 
 
 		 401 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.77 
 
 		 389 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.83 
 
 		 392 aa  308  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.14 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.4 
 
 		 390 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.27 
 
 		 390 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.19 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.4 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.13 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.63 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  42.57 
 
 		 382 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.58 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.71 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  48 
 
 		 387 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02210  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.34 
 
 		 466 aa  294  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63523  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.89 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.27 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.85 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1867  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.41 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0183608  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2556  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.84 
 
 		 410 aa  290  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00135119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.88 
 
 		 408 aa  288  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.41 
 
 		 396 aa  285  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.15 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.26 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.49 
 
 		 403 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1720  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.56 
 
 		 382 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0359969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.56 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.56 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1802  aminotransferase class I and II  45.76 
 
 		 397 aa  279  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.09 
 
 		 390 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.97 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1752  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.21 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.12 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.19 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2526  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.22 
 
 		 406 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.19 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.74 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.74 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.74 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.74 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.74 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.27 
 
 		 389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.74 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1759  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.33 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0115  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.05 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2430  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.06 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.47 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.76 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0339  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.78 
 
 		 394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.76 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.89 
 
 		 405 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2358  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.06 
 
 		 406 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.16 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1476  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.58 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1796  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.35 
 
 		 412 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0638776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.6 
 
 		 396 aa  262  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2739  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.71 
 
 		 401 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.53 
 
 		 391 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2518  aminotransferase, class I and II  43.62 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000907051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2811  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.46 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.53 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.61 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.78 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0148  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.7 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.68 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>