More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1720 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1720  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 382 aa  776    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0359969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1867  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.55 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0183608  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.52 
 
 		 396 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.9 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1752  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.96 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2526  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.22 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1759  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.33 
 
 		 406 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1796  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.35 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0638776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2739  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.1 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2518  aminotransferase, class I and II  54.87 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000907051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1476  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.1 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1802  aminotransferase class I and II  54.83 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2358  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.36 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2430  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.61 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1659  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.4 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1439  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.59 
 
 		 385 aa  335  7e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00843226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.43 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.17 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.97 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.64 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.9 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.12 
 
 		 385 aa  279  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.39 
 
 		 392 aa  276  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.9 
 
 		 397 aa  276  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.6 
 
 		 385 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.83 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.74 
 
 		 401 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.23 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.01 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.72 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.5 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.78 
 
 		 389 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.62 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.23 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.08 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.01 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.08 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.01 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.65 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.46 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.08 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.82 
 
 		 391 aa  263  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.9 
 
 		 394 aa  262  8.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.36 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.82 
 
 		 385 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2556  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.3 
 
 		 410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00135119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.83 
 
 		 396 aa  259  7e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.38 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.51 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1426  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.5 
 
 		 383 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.02 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.37 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2843  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.13 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2930  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.13 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.56 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.32 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1312  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.39 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.11 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.03 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.97 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  39.73 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.74 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.44 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.74 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.74 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  44.74 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.44 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.64 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.37 
 
 		 397 aa  249  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.69 
 
 		 392 aa  249  6e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.35 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.68 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.07 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02210  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.68 
 
 		 466 aa  242  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63523  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.94 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.94 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.89 
 
 		 396 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.49 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.66 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0168  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.99 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.44 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02875  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.5 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.35 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.64 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1041  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.79 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.06 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.45 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0934  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.79 
 
 		 384 aa  234  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.3 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.13 
 
 		 393 aa  232  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.5 
 
 		 411 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.96 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.84 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.83 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.35 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.9 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.15 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.15 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.46 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.98 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>