More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1867 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1867  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
400 aa  812    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0183608  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  69.87 
 
 
396 aa  544  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  63.17 
 
 
403 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2526  8-amino-7-oxononanoate synthase  64.01 
 
 
406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1752  8-amino-7-oxononanoate synthase  63.75 
 
 
406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1759  8-amino-7-oxononanoate synthase  63.38 
 
 
406 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2739  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.24 
 
 
401 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1796  8-amino-7-oxononanoate synthase  64.05 
 
 
412 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0638776  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2430  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.95 
 
 
406 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2518  aminotransferase, class I and II  62.79 
 
 
406 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000907051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2358  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.27 
 
 
406 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000259598 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1720  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.55 
 
 
382 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0359969  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1802  aminotransferase class I and II  57.22 
 
 
397 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1476  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.93 
 
 
399 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1659  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.83 
 
 
406 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1439  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.88 
 
 
385 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00843226  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.93 
 
 
384 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.75 
 
 
385 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.08 
 
 
383 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2556  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.86 
 
 
410 aa  285  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00135119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.27 
 
 
383 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1312  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.34 
 
 
383 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.7 
 
 
385 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.19 
 
 
383 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.75 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2843  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.93 
 
 
383 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2930  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.93 
 
 
383 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.29 
 
 
384 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  42 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1426  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.63 
 
 
383 aa  270  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  45 
 
 
384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  45 
 
 
384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  45 
 
 
384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  45 
 
 
384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.94 
 
 
384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 
394 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.71 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.9 
 
 
385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.71 
 
 
384 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.82 
 
 
403 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.41 
 
 
384 aa  265  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.9 
 
 
385 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.9 
 
 
385 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.56 
 
 
386 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.82 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.28 
 
 
392 aa  262  8e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.6 
 
 
385 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.9 
 
 
392 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.6 
 
 
385 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.55 
 
 
389 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.05 
 
 
387 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.43 
 
 
391 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.73 
 
 
397 aa  257  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02210  8-amino-7-oxononanoate synthase  37 
 
 
466 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63523  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.35 
 
 
386 aa  256  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.62 
 
 
396 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.89 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.12 
 
 
392 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.39 
 
 
391 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.58 
 
 
401 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.84 
 
 
401 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.03 
 
 
390 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.76 
 
 
392 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.3 
 
 
390 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02875  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.49 
 
 
379 aa  249  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.35 
 
 
384 aa  249  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.14 
 
 
396 aa  247  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.89 
 
 
387 aa  247  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.49 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  40.86 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.82 
 
 
396 aa  243  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.75 
 
 
387 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.3 
 
 
390 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.46 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.04 
 
 
395 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.48 
 
 
389 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.17 
 
 
401 aa  236  7e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.17 
 
 
401 aa  236  7e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.36 
 
 
389 aa  236  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.29 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.9 
 
 
390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.47 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.6 
 
 
408 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.28 
 
 
388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.32 
 
 
393 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.37 
 
 
395 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.73 
 
 
399 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.76 
 
 
396 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.16 
 
 
391 aa  229  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.43 
 
 
384 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.52 
 
 
395 aa  227  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.91 
 
 
399 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.51 
 
 
396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.04 
 
 
392 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.32 
 
 
395 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.02 
 
 
395 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.69 
 
 
391 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.16 
 
 
390 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.02 
 
 
395 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.02 
 
 
395 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>