More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003870 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  92.65 
 
 		 383 aa  739    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 383 aa  793    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  65.25 
 
 		 384 aa  519  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.32 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.77 
 
 		 385 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.77 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.5 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.21 
 
 		 385 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.5 
 
 		 385 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.5 
 
 		 385 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.28 
 
 		 384 aa  363  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.99 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.71 
 
 		 384 aa  359  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.71 
 
 		 384 aa  358  9e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.42 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.42 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.4 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  52.42 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.42 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.42 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.42 
 
 		 382 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.74 
 
 		 385 aa  348  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.87 
 
 		 384 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.05 
 
 		 392 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1312  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.13 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2930  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.53 
 
 		 383 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2843  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.53 
 
 		 383 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1426  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.53 
 
 		 383 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.04 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.41 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.68 
 
 		 392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.49 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1720  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.97 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0359969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1802  aminotransferase class I and II  46.07 
 
 		 397 aa  292  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.09 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02210  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.95 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63523  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.22 
 
 		 403 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  42.24 
 
 		 382 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.52 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.83 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1867  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.08 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0183608  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.38 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.26 
 
 		 403 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2526  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.67 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.51 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.82 
 
 		 392 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2556  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.86 
 
 		 410 aa  277  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00135119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.91 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.19 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.96 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.33 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1752  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.02 
 
 		 406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.09 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.3 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1759  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.4 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.05 
 
 		 389 aa  272  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.38 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.59 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.43 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1476  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.05 
 
 		 399 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0934  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.65 
 
 		 384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1796  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.86 
 
 		 412 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0638776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1041  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.38 
 
 		 384 aa  265  8e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660772  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2739  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.95 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.43 
 
 		 410 aa  262  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.89 
 
 		 384 aa  258  9e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.69 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.24 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2518  aminotransferase, class I and II  42.74 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000907051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.54 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.38 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2430  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.73 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.64 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.82 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.72 
 
 		 401 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2358  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.24 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.05 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02875  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.21 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1659  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.04 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.25 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.56 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.19 
 
 		 393 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.42 
 
 		 391 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.18 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.38 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.58 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.86 
 
 		 395 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.67 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.42 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.2 
 
 		 395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  37 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.93 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.58 
 
 		 397 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.29 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.84 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1439  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.12 
 
 		 385 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00843226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0962  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.27 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0636992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.84 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.89 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.67 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>