More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2595 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  100 
 
 
382 aa  792    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.16 
 
 
383 aa  302  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.27 
 
 
384 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.75 
 
 
392 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.42 
 
 
385 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.24 
 
 
383 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.07 
 
 
383 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.95 
 
 
386 aa  290  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.62 
 
 
390 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.47 
 
 
385 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.47 
 
 
385 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.47 
 
 
385 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.47 
 
 
385 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.65 
 
 
390 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.86 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.21 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2556  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.69 
 
 
410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00135119  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.14 
 
 
385 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.76 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.57 
 
 
384 aa  282  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.78 
 
 
384 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.21 
 
 
384 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.24 
 
 
401 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.49 
 
 
384 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  42.49 
 
 
384 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.49 
 
 
384 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.49 
 
 
384 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.92 
 
 
396 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02210  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.39 
 
 
466 aa  279  5e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.78 
 
 
384 aa  278  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.59 
 
 
394 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.06 
 
 
403 aa  275  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.34 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.84 
 
 
385 aa  272  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.24 
 
 
396 aa  272  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.02 
 
 
391 aa  272  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.25 
 
 
392 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.97 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.25 
 
 
389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.48 
 
 
382 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 
384 aa  266  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.62 
 
 
387 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.67 
 
 
392 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1802  aminotransferase class I and II  44.48 
 
 
397 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.62 
 
 
384 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1312  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.11 
 
 
383 aa  258  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.68 
 
 
392 aa  258  1e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.84 
 
 
390 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.06 
 
 
387 aa  256  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2843  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.11 
 
 
383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.16 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.31 
 
 
410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2930  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.11 
 
 
383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.57 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1720  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.73 
 
 
382 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0359969  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.79 
 
 
403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1426  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.85 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2739  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.94 
 
 
401 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.56 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1867  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.86 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0183608  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.24 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.57 
 
 
386 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.02 
 
 
396 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.77 
 
 
390 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2430  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.77 
 
 
406 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1752  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.78 
 
 
406 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2526  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.46 
 
 
406 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0196753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2358  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.94 
 
 
406 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000259598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.56 
 
 
396 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.61 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.61 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1796  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.23 
 
 
412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0638776  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.89 
 
 
384 aa  236  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2518  aminotransferase, class I and II  43.03 
 
 
406 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000907051 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.9 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.66 
 
 
389 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.71 
 
 
389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1476  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.36 
 
 
399 aa  233  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1759  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.92 
 
 
406 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.1 
 
 
391 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.89 
 
 
395 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.75 
 
 
405 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.16 
 
 
405 aa  229  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.13 
 
 
391 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.68 
 
 
396 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.43 
 
 
390 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.49 
 
 
390 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.88 
 
 
396 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.86 
 
 
395 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.96 
 
 
394 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.36 
 
 
389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.36 
 
 
389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.59 
 
 
395 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.4 
 
 
395 aa  222  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.41 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.86 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.75 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.47 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0934  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.16 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3828  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.29 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>