More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1478 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1478  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 416 aa  823    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0815886  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1436  8-amino-7-oxononanoate synthase  85.19 
 
 		 415 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.469568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1372  8-amino-7-oxononanoate synthase  84.58 
 
 		 415 aa  655    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.134715  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.02 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.14 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2811  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.31 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0115  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.98 
 
 		 406 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0148  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.3 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.14 
 
 		 405 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.25 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.42 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.91 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.46 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.46 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.46 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.46 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.46 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.46 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.46 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.77 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0339  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.71 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2947  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.79 
 
 		 406 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0373  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.95 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.04 
 
 		 411 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6276  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.97 
 
 		 400 aa  352  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2844  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.74 
 
 		 445 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956659  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2318  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.29 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2932  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.29 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2981  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.49 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0168  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.97 
 
 		 411 aa  342  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.13 
 
 		 387 aa  336  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.2 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.13 
 
 		 386 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.06 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 		 405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.01 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.87 
 
 		 396 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.5 
 
 		 396 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.45 
 
 		 390 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.52 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.26 
 
 		 387 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.86 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.53 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.92 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0898  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.49 
 
 		 405 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.65 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.41 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.46 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.32 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.8 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.14 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.91 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.26 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.23 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.64 
 
 		 391 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.82 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.81 
 
 		 390 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3843  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.21 
 
 		 412 aa  276  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.36 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.58 
 
 		 390 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0320  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.35 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569428  normal  0.0137609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.04 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.02 
 
 		 393 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.52 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.83 
 
 		 386 aa  262  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.5 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.51 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  41.83 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.11 
 
 		 384 aa  259  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.32 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.55 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.29 
 
 		 385 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1346  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.55 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.0485323 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.9 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.01 
 
 		 384 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.29 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.29 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.29 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.81 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.88 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  39.95 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.31 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.74 
 
 		 384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.31 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.74 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  42.74 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.74 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.74 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.2 
 
 		 391 aa  246  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.39 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.25 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.56 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  43 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.92 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.9 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.19 
 
 		 395 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.93 
 
 		 383 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.31 
 
 		 385 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.31 
 
 		 385 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0962  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.71 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0636992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>