More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0039 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 395 aa  795    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1868  8-amino-7-oxononanoate synthase  63.19 
 
 		 381 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.231252  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2875  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.14 
 
 		 383 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0814  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.94 
 
 		 386 aa  418  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2132  8-amino-7-oxononanoate synthase  60.23 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1346  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.56 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.404227  normal  0.0485323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0857  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.88 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0484111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0816  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.43 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.497874  normal  0.203864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6357  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.06 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0781  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.67 
 
 		 387 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.054688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0866  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.7 
 
 		 374 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5168  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.52 
 
 		 379 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206563  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.6 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0171  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.48 
 
 		 367 aa  311  2e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.1403  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0950  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.18 
 
 		 367 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.47 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  40.11 
 
 		 388 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.03 
 
 		 396 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.3 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.27 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.47 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.65 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.65 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.8 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.11 
 
 		 390 aa  275  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  38.28 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.18 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0317  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.4 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.31 
 
 		 391 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.26 
 
 		 391 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.58 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.69 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.98 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.68 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.88 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.88 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.77 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.57 
 
 		 399 aa  260  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.46 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.17 
 
 		 395 aa  256  6e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.36 
 
 		 384 aa  255  8e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.67 
 
 		 395 aa  255  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.17 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.05 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.48 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.76 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.17 
 
 		 384 aa  252  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.53 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.15 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.93 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.96 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1051  8-amino-7-oxononanoate synthase  40 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.307967  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.51 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.79 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.04 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0680  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.21 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.7 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.7 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.7 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2473  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.58 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00670549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0106  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.01 
 
 		 392 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.209917  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.11 
 
 		 392 aa  245  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0142  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.38 
 
 		 407 aa  245  9e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0560736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.2 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.6 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.1 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.42 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.4 
 
 		 390 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.78 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.78 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.25 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.29 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.31 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1111  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.03 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0567781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.91 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.33 
 
 		 386 aa  240  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.58 
 
 		 395 aa  240  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.53 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.18 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.12 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.11 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.62 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.44 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.43 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.38 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.82 
 
 		 403 aa  236  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.24 
 
 		 501 aa  236  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.49 
 
 		 395 aa  236  7e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0031  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.28 
 
 		 395 aa  235  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1096  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.87 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1419  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.67 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.58 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.2 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  38.24 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.22 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.71 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.77 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0002  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.19 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.75 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.47 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>