29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3425 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3425  general secretion pathway M protein  100 
 
 		 170 aa  315  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3134  general secretion pathway protein M  59.84 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.013923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0919  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3527  hypothetical protein  44.16 
 
 		 197 aa  84.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0359597  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0758  hypothetical protein  37.65 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5695  hypothetical protein  45 
 
 		 186 aa  73.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1327  hypothetical protein  39.47 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0669  hypothetical protein  40.38 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0648  hypothetical protein  41.67 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0540  hypothetical protein  38.74 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1075  hypothetical protein  40.36 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  33.72 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  33.77 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  32.67 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  34.42 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  34.42 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  33.33 
 
 		 202 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  30 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  33.56 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  33.76 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  34.29 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  34.29 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  33.12 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  32.52 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  29.58 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  34.39 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  34.39 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2212  putative type II secretion system protein  29.55 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  32.88 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>