16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0669 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0669  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  336  9e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0648  hypothetical protein  97.79 
 
 		 181 aa  227  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0243337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0919  hypothetical protein  55.1 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3527  hypothetical protein  51.58 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0359597  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5695  hypothetical protein  52.69 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1327  hypothetical protein  52.35 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0758  hypothetical protein  46.34 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1075  hypothetical protein  50.92 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0540  hypothetical protein  53.64 
 
 		 165 aa  92.8  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3134  general secretion pathway protein M  39.77 
 
 		 168 aa  88.2  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.013923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3425  general secretion pathway M protein  40.59 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  31.72 
 
 		 202 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3176  general secretion pathway M protein  33.57 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317851  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  26.92 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  27.67 
 
 		 192 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55460  type II secretion system protein  25.84 
 
 		 197 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000029628  normal  0.0351347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>