16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0648 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0648  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  337  8e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0243337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0669  hypothetical protein  97.79 
 
 		 181 aa  246  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0919  hypothetical protein  55.61 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3527  hypothetical protein  51.58 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0359597  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5695  hypothetical protein  52.69 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1327  hypothetical protein  52.94 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0758  hypothetical protein  46.95 
 
 		 167 aa  118  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1075  hypothetical protein  51.53 
 
 		 172 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3134  general secretion pathway protein M  41.52 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.013923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0540  hypothetical protein  52.73 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3425  general secretion pathway M protein  41.76 
 
 		 170 aa  84.3  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  32.41 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  28.76 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  27.56 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3176  general secretion pathway M protein  34.51 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317851  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  28.87 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>