17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0919 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0919  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3527  hypothetical protein  55.84 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0359597  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0669  hypothetical protein  53.33 
 
 
181 aa  135  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5695  hypothetical protein  58.52 
 
 
186 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0427394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0648  hypothetical protein  53.85 
 
 
181 aa  122  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0243337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0758  hypothetical protein  50.34 
 
 
167 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1327  hypothetical protein  51.68 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1075  hypothetical protein  46.77 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3425  general secretion pathway M protein  48.18 
 
 
170 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3134  general secretion pathway protein M  43.59 
 
 
168 aa  88.6  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.013923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0540  hypothetical protein  43.43 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  27.11 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  32.69 
 
 
202 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3176  general secretion pathway M protein  34.75 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317851  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  33.56 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  32.85 
 
 
167 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  27.07 
 
 
164 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>