13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1075 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1075  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  326  9e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0919  hypothetical protein  47.26 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1327  hypothetical protein  54.6 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3527  hypothetical protein  47.28 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0359597  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0758  hypothetical protein  45.78 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5695  hypothetical protein  48.52 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0669  hypothetical protein  50.62 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0648  hypothetical protein  51.23 
 
 		 181 aa  84.7  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0540  hypothetical protein  50.43 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3425  general secretion pathway M protein  40.36 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3134  general secretion pathway protein M  37.13 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.013923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3176  general secretion pathway M protein  34.72 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317851  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  30.83 
 
 		 188 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>