15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3134 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3134  general secretion pathway protein M  100 
 
 		 168 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.013923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3425  general secretion pathway M protein  54.27 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0919  hypothetical protein  44.6 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3527  hypothetical protein  41.48 
 
 		 197 aa  87.4  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0359597  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1327  hypothetical protein  38.71 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0758  hypothetical protein  38.31 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0540  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0669  hypothetical protein  40.36 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0648  hypothetical protein  42.26 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0243337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1075  hypothetical protein  37.13 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5695  hypothetical protein  41.79 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  32.06 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06070  hypothetical protein  34.43 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  31.3 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  29.03 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>