13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5695 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5695  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  351  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0919  hypothetical protein  49.49 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264714  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3527  hypothetical protein  49.44 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0359597  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0669  hypothetical protein  55.42 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252415 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0648  hypothetical protein  55.42 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1327  hypothetical protein  45.93 
 
 		 167 aa  99  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1075  hypothetical protein  48.52 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0758  hypothetical protein  38.73 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3425  general secretion pathway M protein  43.92 
 
 		 170 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0540  hypothetical protein  44.38 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3134  general secretion pathway protein M  38.71 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.013923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  30.23 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  31.97 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>