86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13900 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  100 
 
 		 286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  52.38 
 
 		 282 aa  289  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  55.39 
 
 		 294 aa  288  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  52.55 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  53.16 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  51.47 
 
 		 283 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  53.51 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  50.19 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  50.55 
 
 		 286 aa  271  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  49.82 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  50.53 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  50.92 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  48.91 
 
 		 289 aa  265  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  51.64 
 
 		 285 aa  265  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  50 
 
 		 288 aa  265  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  49.26 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  51.11 
 
 		 280 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  48.55 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  51.11 
 
 		 280 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  52.38 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  49.12 
 
 		 301 aa  261  8.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  49.63 
 
 		 281 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  46.86 
 
 		 301 aa  258  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  49.1 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  48.38 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  49.64 
 
 		 286 aa  248  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  46.98 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  46.43 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  46.72 
 
 		 282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  48.91 
 
 		 292 aa  244  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  45.69 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  46.91 
 
 		 296 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  46.91 
 
 		 296 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  46.91 
 
 		 296 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  42.48 
 
 		 269 aa  214  9e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  44.17 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  39.86 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  39.44 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  32.75 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  34.06 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  29.82 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  31.2 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  28.62 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  28.28 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  28.87 
 
 		 342 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  28.77 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  28.77 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  28.77 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  29.2 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  29.92 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  27.68 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  27.74 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  30.34 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  26.53 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  26.79 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  26.62 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.11 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  27.18 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  27.4 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  25.94 
 
 		 301 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  28 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  27.92 
 
 		 312 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  26.8 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  26.81 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  26.56 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  26.21 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  26.74 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  26.35 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  25.36 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  25.17 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  27 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  26.85 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  25.35 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  26.95 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  25.09 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  25.61 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  23.26 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  23.21 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  21.29 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  21.67 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  21.59 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  19.43 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  19.43 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  18.62 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  19.13 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>