84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2785 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
286 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  66.79 
 
 
298 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  64.06 
 
 
290 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  60.35 
 
 
301 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  64.58 
 
 
286 aa  363  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  60.85 
 
 
296 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  60 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  60.29 
 
 
296 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  60.29 
 
 
296 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  60.29 
 
 
296 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  59.29 
 
 
288 aa  349  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  59.42 
 
 
283 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  57.71 
 
 
292 aa  328  7e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  55.86 
 
 
289 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  55.52 
 
 
289 aa  318  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  57.04 
 
 
284 aa  311  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  58.8 
 
 
294 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  58.67 
 
 
280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  55.19 
 
 
284 aa  298  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  57.93 
 
 
280 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  53.7 
 
 
282 aa  292  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  57.45 
 
 
286 aa  292  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  53.96 
 
 
285 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  54.81 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  53.33 
 
 
279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  53.7 
 
 
283 aa  275  7e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  52.61 
 
 
302 aa  274  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  51.48 
 
 
301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  51.11 
 
 
301 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  50.36 
 
 
283 aa  262  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  49.82 
 
 
306 aa  261  8.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  46.55 
 
 
297 aa  259  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  47.45 
 
 
282 aa  255  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  46.15 
 
 
296 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  48.38 
 
 
286 aa  236  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  42.86 
 
 
299 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  45.74 
 
 
316 aa  225  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  42.48 
 
 
269 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  38.73 
 
 
311 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  32.16 
 
 
277 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  36.6 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  31.65 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  28.62 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  28.52 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  28.18 
 
 
306 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  27.18 
 
 
342 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  26.52 
 
 
329 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  26.94 
 
 
315 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  26.81 
 
 
312 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  27.37 
 
 
330 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  25.85 
 
 
334 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  25.85 
 
 
334 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  25.85 
 
 
334 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  25.94 
 
 
313 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  28.18 
 
 
324 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  27.7 
 
 
307 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  26.86 
 
 
312 aa  98.6  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  25.52 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  25.55 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  24.73 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  27.61 
 
 
314 aa  95.9  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  29.51 
 
 
312 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  25.86 
 
 
304 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  27.92 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  24.37 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  26.67 
 
 
325 aa  92.4  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  26.76 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  24.9 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  28.12 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  26.88 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  23.86 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  25.86 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  26.91 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  22.73 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  25.9 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  25.09 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  23.13 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  23.02 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  25.54 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  23.48 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  23.79 
 
 
276 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  22.27 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  19.37 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  19.8 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>